AIPC首届挑战赛圆满落幕：以人工智能驱动蛋白质组学智能化发展
8月6日，由西湖大学医学院郭天南团队联合北京科学智能研究院、深势科技共同发起的人工智能蛋白质组学系列赛（AI Proteomics Competition, AIPC）首届挑战赛颁奖典礼在西湖大学举行。颁奖典礼作为 Westlake AIVC Week 2026 的重要环节之一，与 Westlake AI Virtual Cells International Symposium 同期举行，来自国内外高校、科研院所和产业界的专家学者及参会者共同见证首届赛事获奖团队揭晓。
AIPC聚焦人工智能与生命科学交叉领域，旨在推动AI技术在蛋白质组学数据解析、智能算法开发以及未来AI虚拟细胞（AI Virtual Cell, AIVC）构建中的创新应用。
自赛事启动以来，AIPC面向全球科研人员、学生、工程师及AI创新团队开放报名，吸引了来自生命科学、人工智能、计算机科学等多个领域的400余名参赛者参与，累计提交近千次比赛结果。通过这一跨学科平台，参赛者围绕蛋白质组学中的实际问题展开算法开发与模型探索，推动人工智能与蛋白质组学的进一步融合。
聚焦核心挑战
利用AI提升蛋白质鉴定可靠性
质谱（Mass Spectrometry, MS）蛋白质组学能够系统解析生命体系中的蛋白表达、修饰、相互作用以及动态变化，是疾病机制研究、生物标志物发现和精准医疗发展的重要技术基础。
然而，随着质谱技术快速发展，实验数据规模持续增长，数据复杂性、噪声干扰以及分析流程中的计算挑战也日益突出。如何充分挖掘质谱数据中隐藏的信息，提升蛋白质鉴定深度与准确性，仍是当前蛋白质组学领域的重要问题。
AIPC 首届挑战赛聚焦 肽谱-谱图匹配（Peptide–Spectrum Matches, PSMs）重打分任务。PSM 重打分是蛋白质鉴定流程中的关键环节，通过人工智能算法对传统搜索引擎产生的候选匹配结果进行重新评估，可以有效提高鉴定准确性，为后续蛋白定量分析、功能注释以及生物学研究提供更加可靠的数据基础。
本次比赛开放了两个赛道：
• 基础赛道（约 45 million PSMs）
• 高级赛道（约 300 million PSMs）
参赛者基于主办方提供的标准化 DDA-MS 数据集，开发人工智能模型，实现 PSM 质量评估与优化。为降低数据处理门槛，赛事组委会对原始质谱数据进行了统一预处理，并转换为高效存储与读取的格式，使参赛团队能够更加专注于模型设计、算法创新以及性能提升。
全球参赛
共探 AI+蛋白质组学新方向
经过9个月的激烈角逐，共有455人参与比赛，累计提交980次结果，最终26支队伍进入排行榜。参赛团队围绕深度学习、表示学习、特征融合、排序优化等方向展开探索，提出了多种创新性的解决方案，充分展示了人工智能技术在复杂生命科学数据分析中的巨大潜力。
比赛过程中，选手们不仅关注模型性能提升，也积极探索算法在不同质谱平台、不同物种数据以及真实科研场景中的泛化能力，为未来构建更加智能化、自动化的蛋白质组学分析体系提供了重要参考。
获奖名单
经过A、B榜单加权总分排名、代码审核、内部数据FDP审核的严格评审，本次比赛最终评选出各赛道优秀团队。
基础赛道获奖团队
一等奖（奖金 ¥ 30,000）
应用文 团队：俞义文
（左起：李剑峰、俞义文、郭天南）
二等奖（奖金 ¥ 10,000）
鼠鼠在看书 团队：熊鹏，许红涛
（左起：郭天南、熊鹏、周晓斌）
三等奖（奖金 ¥ 5000）
PUpc 团队：赵伟，牟硕，顾晓兰
（左起：郭天南、赵伟、牟硕、顾晓兰、周晓斌）
高级赛道获奖团队
一等奖（奖金 ¥ 30,000）
Foldit 团队：杨瑞刚，陈泽轩
（左起：江峥、刘志伟（代领人）、郭天南）
二等奖（奖金 ¥ 10,000）
bohrca1259 团队：宋健
（左起：江峥、宋健、郭天南）
三等奖（奖金 ¥ 5000）
Yu-7 团队：梁宸宇，江文彬，查宇龙
（左起：李剑峰、梁宸宇、郭天南）
再次祝贺所有获奖团队，也感谢所有参赛选手在比赛期间的积极参与和精彩贡献！
AIPC 首届挑战赛的成功举办，离不开各合作单位的大力支持。本次赛事由西湖大学医学院郭天南团队联合北京科学智能研究院、深势科技共同发起，并获得：
• 上海爱博才思分析仪器贸易有限公司（SCIEX）
• 北京科学智能研究院
• 布鲁克（北京）科技有限公司
• 西湖大学高性能计算中心
等单位的支持。
同时，感谢赛事平台 Bohrium® 为参赛选手提供稳定的计算环境与技术支持，为全球研究者开展 AI+生命科学探索提供便利条件。
面向未来
推动人工智能驱动生命科学创新
AIPC 不仅是一场算法竞赛，更是一个连接人工智能与生命科学的开放创新平台。
未来，随着人工智能模型、多组学数据以及计算生物学技术的发展，AI 将在蛋白质组学分析、疾病机制解析、新药研发以及 AI 虚拟细胞构建等方向发挥越来越重要的作用。AIPC 将持续关注人工智能与生命科学交叉领域的发展，推动更多开放数据、创新算法与科研应用的融合，期待与全球研究者共同探索生命科学智能化的新未来。
再次感谢所有参赛选手、合作伙伴以及关注和支持 AIPC 的科研社区！
第二届 AI Proteomics Competition 赛事即将拉开帷幕，请大家关注guomics公众号后续推文，让我们共同期待新的角逐！
