分析报告:质谱在欧美国家临床检验中的应用(长文)
分析测试百科网讯 医学检验、体外诊断、临床等关键词对分析仪器的影响越来越大。作为分析仪器中发展最晚,当前热度最高的质谱,也纷纷向临床领域拓展。为此,分析测试百科网编译了此份质谱仪器在欧美国家临床检验中的应用报告,供国内研究学者参考使用。分析测试百科网还将陆续关注更多分析仪器在临床检验中的应用情况。
临床诊断市场总结:
在肿瘤检测领域,质谱法的应用并未使得肿瘤的外显率增加;在治疗相关突变检测方面,定量PCR占主导地位,并且NGS(下一代测序)的应用越来越成为趋势。
在诊断领域,一方面,越来越多的质谱试剂盒和设备获得批准并用于临床诊断,质谱的应用可能会使得FDA批准的生物标志物增加;另一方面,质谱法被越来越多的用于生物标志物的确认,并且被公认为是临床生物标志物发现和确证的首选方法。另外,质谱法还被用于蛋白质和核酸的检测。
质谱对临床诊断细分市场的影响:
受质谱影响的临床诊断细分市场
产前检查
新生儿筛查
滥用药物监测(下游分析)
代谢物检查(氨基酸、脂肪酸)
类固醇激素(内分泌失调)
维生素族
微生物学
总结质谱的应用市场如下:
1.质谱的应用市场主要集中在临床诊断领域
2.质谱对微生物诊断有一定影响
3.质谱在癌症和肿瘤领域应用不多(由癌症生物标记研究的权威报告得出)
4.质谱开始影响蛋白质和多肽的定量分析(新兴起在发展中的应用)
质谱法的检测项目大多属于LDTs(实验室自主开发的项目)
这个报告接下来的图表呈现了一些商业化运作的质谱实验室自主开发的项目(LTDs)。
市场上也存在一些使用质谱的体外诊断试剂(IVDs),但它不是这个报告的主要关注点。
本报告的目的是想通过对已经开发和市场化的质谱LDTs项目的广度和多样性的展示,说明质谱在临床诊断应用的多样性和机会。
基于质谱检测的实验室自主开发的项目(LTDs)
机构 | 针对的疾病领域 | 利用的MS技术 | 其他信息 |
美国西格诺 | 囊性纤维化携带者筛查 | MALDI-TOF MS | 从集成DNA技术得到测试103个已知突变和5个变种ASR的引物。 |
体细胞突变分析 | MALDI-TOF MS | EGFRT2582A | |
胎儿敏感基因RHD基因分型的测试 | MALDI-TOF MS | 妊娠妇女循环细胞中胎儿游离核酸的检测分析(核糖核酸或脱氧核糖核酸) | |
胎儿染色体非整倍体的测定 | MALDI-TOF MS | 从母体血液样本的循环细胞游离DNA中分析21,18,13和Y染色体物质的相对量 | |
Labcorp(US) | CAH孕烯醇酮检测(CAH是指先天性肾上腺皮质增生症) | LC/MS/MS | |
游离胆酸,甘氨胆酸,牛黄胆酸,鹅去氧胆酸,脱氧胆酸,熊去氧胆酸的定量。用于妊娠梗阻性胆汁淤积症的研究。 | LC/MS/MS | ||
用于雄激素过量/缺乏检测的游离睾酮定量分析 | LC/MS/MS | ||
Esoterix | 游离和非蛋白结合的甲状腺素检测 | ED(平衡透析)-LC/MS/MS | |
甲状腺功能亢进和减退症诊断的三碘甲状腺原氨酸检测 | ED(平衡透析)-LC/MS/MS | 三碘甲状腺原氨酸 | |
下丘脑-垂体-肾上腺轴和垂体 ACTH 储备评价 | LC/MS/MS | ||
盐皮质激素过多症(AME) | LC/MS/MS | ||
唾液皮质醇试验诊断库欣综合征 | LC/MS/MS | 皮质醇 | |
醛固酮检测 (Conn -原发性醛固酮增多症诊断) | LC/MS/MS | 醛固酮 | |
胆汁酸代谢先天缺陷筛查 | LC/MS/MS | 胆汁酸-鹅脱氧胆酸;胆酸;脱氧胆酸和熊去氧胆酸 | |
NewGene(英国) | KRAS 突变测试-用于25种不同的突变测试 | 基于Sequenom MALDI-TOF平台的Mass Array分子量列阵基因分析系统 | SNP测试-在多重反应中,根据PCR反应,寡核苷酸由一个单独的碱基扩增,这个碱基在野生型或是突变序列的每个位点中是特殊的 |
EGFR -用于接受吉非替尼和厄洛替尼治疗的非小细胞肺癌患者的适用性测试 | 基于Sequenom MALDI-TOF平台的Mass Array分子量列阵基因分析系统 | SNP测试 | |
BRAF (V600E) -用于Vemurafenib治疗的适用性测试 | 基于Sequenom MALDI-TOF平台的Mass Array 分子量列阵基因分析系统 | SNP测试 | |
硫唑嘌呤治疗时,TPMT基因分型的药物不良反应预测测试-硫嘌呤甲基转移酶的多态性 | 基于Sequenom MALDI-TOF平台的Mass Array分子量列阵基因分析系统 | SNP测试 | |
GIST变异分析-两步靶向筛查cKIT和PDGFRA基因突变频率最高的部位 | 基于Sequenom MALDI-TOF平台的Mas Array分子量列阵基因分析系统 | SNP测试 | |
Perkin Elmer(PKI) 遗传学 | 新生儿筛查-一次测试筛查60多种化学关系(包括脂肪酸氧化和氨基酸代谢紊乱) | 串联质谱 | |
PKU | 串联质谱 | 苯丙氨酸和酪氨酸水平 | |
分析辛酰肉碱和葵酰肉碱检测MCAD缺乏和MADD | 串联质谱 | 辛酰肉碱升高水平与葵酰肉碱水平的比值 | |
CPT II 缺乏 | 串联质谱 | 长链酰基肉碱(即C16,C18,C18:1和C18:2)不明确 | |
高酪氨酸血症1型,表现为渐进性肝肾损伤症状 | 串联质谱 | 琥珀酰丙酮和酪氨酸 | |
肉碱/酰基肉碱转位酶缺乏症 | 串联质谱 | 几种长链酰基肉碱水平升高(即C16,C18,C18:1和C18:2) | |
肉碱棕榈酰转移酶I缺乏症TypeI(CPTI) | 串联质谱 | 游离肉碱升高和长链酰基肉碱降低(即C16:0和C18:0),游离肉碱和长链酰基肉碱(即C16:0和C18:0)的比值增高 | |
3-羟基长链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症(LCHAD) | 串联质谱 | 几种长链羟酰基肉碱水平升高(即C16-OH,C16:1-OH,C18-OH,C18:1-OH,C18:2-OH和C12到C14相关种类) | |
2,4-二烯酰辅酶 A 还原酶缺乏症 | 串联质谱 | 酰基肉碱C10:2 | |
中链酰基辅酶 A 脱氢酶缺乏症 | 串联质谱 | 辛酰肉碱(C8酰基肉碱)水平升高,通常伴随着C10、C6、和C10:1肉碱酯类的生成 | |
三功能蛋白缺乏症 | 串联质谱 | 几种长链酰基肉碱和羟酰基肉碱(即C16-OH,C16:1-OH,C16,C18-OH,C18:1-OH和C18) | |
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG)裂解酶缺陷症 | 串联质谱 | 六碳二羧酸酰基肉碱(C6-DC)和C5羟酰基肉碱(C5-OH)升高 | |
戊二酸血症I 型(GAI) | 串联质谱 | 戊二酸共价结合酰基肉碱(C5二羧基酰基肉碱,C5-DC) | |
异丁酰辅酶 A 脱氢酶缺乏症 | 串联质谱 | C4升高 | |
异戊酸血症 (IVA) | 串联质谱 | C5升高 | |
甲基丙二酸血症 | 串联质谱 | C3升高表示可能有代谢缺陷,MMA或丙酸血症 | |
丙酸血症 (PA) | 串联质谱 | C3 | |
丙二酸血症 | 串联质谱 | 丙二酰基肉碱升高 | |
精氨酸血症 | 串联质谱 | 精氨酸升高5到10倍 | |
精氨酸尿症 | 串联质谱 | 瓜氨酸水平升高 | |
5-羟脯氨酸尿症 | 串联质谱 | 5-氧脯氨酸水平升高,表明需要进一步检验 | |
Mayo Clinic (Mayo Medical Laboratories) | 新生儿筛查服务 | 串联质谱 | |
儿童CAH诊断 | LC-MS/MS | 雄烯二酮,要求与雄激素前体(OHPG,17-α-羟基孕烯醇酮)一起测量 | |
氨基酸代谢 | 串联质谱 | 牛磺酸、苏氨酸、 丝氨酸、 天冬酰胺,谷氨酸、谷氨酰胺、脯氨酸,瓜氨酸、丙氨酸、α-氨基-n-丁酸、缬氨酸、胱氨酸、甲硫氨酸,丁酸、缬氨酸、胱氨酸、甲硫氨酸,苯丙氨酸、β-丙氨酸、鸟氨酸,赖氨酸、组氨酸、精氨酸、异亮氨酸、 磷酸丝氨酸,磷酸乙醇胺,羟脯氨酸,甘氨酸、天冬氨酸、乙醇胺、肌氨酸、 1-甲基组氨酸,3-甲基组氨酸,肌肽、 鹅肌肽,高瓜氨酸,α-氨基己二酸,γ-氨基-n-丁酸,β-氨基异丁酸,胱硫醚和色氨酸。 | |
脂肪酸代谢 | 串联质谱 | SCAD 缺乏症, MCAD缺乏症, TFP缺乏症, LCHAD缺乏症, VLCAD 缺乏症, CPT-2, CACT | |
有机酸代谢 | 串联质谱 | ||
2M Associates,Inc. | 新生儿筛查服务 | Perkin Elmer API2000 LC/MS/MS系统 | |
氨基酸代谢 | Perkin Elmer API2000 LC/MS/MS系统 | 1.精氨酸尿症(ASA 裂解酶缺陷症)2.高胱氨酸尿症3.高甲硫氨酸血症4.枫糖尿病(MSUD)5.苯丙酮尿症和其他高苯丙氨酸血症6.酪氨酸血症 | |
脂肪酸代谢 | Perkin Elmer API2000 LC/MS/MS系统 | 1.肉碱/酰基肉碱移位酶缺乏症2.中链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症(MCAD)3.多种酰基辅酶A脱氢酶缺乏症(戊二酸血症TypeII)4. 新生儿肉碱棕榈酰转移酶II缺乏症CPT-II)5.短链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症(SCAD)6.三功能蛋白质缺乏症(TFP 缺乏症) | |
有机酸代谢 | Perkin Elmer API2000 LC/MS/MS系统 | 1.3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A (HMG)裂解酶缺陷症2.异戊酸血症 (IVA)3.3-甲基巴豆酰辅酶A羧化酶缺乏症(3MCC缺乏症)4.3-甲基戊烯二酰辅酶A水解酶缺乏症5.甲基丙二酸血症(MMA)6.线粒体乙酰辅酶A硫解酶缺乏症(3-铜硫解酶缺乏) |