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从培养细胞或组织中制备细胞核基质/中间纤维骨架结...

2020.8.17

从培养细胞或组织中制备细胞核基质/中间纤维骨架结构实验



实验材料 细胞

试剂、试剂盒 Tritron X-100抽提缓冲液

仪器、耗材 电子显微镜

实验步骤

1. 在 4℃ 用 PBS 洗细胞一次。


2. 在 4℃ 用含 0.5% Tritron X-100 的细胞骨架缓冲液抽提细胞 3 到 5 分钟。直到消化步骤,每 107 个细胞最少要用 1 ml 缓冲液,以后减半。


3. 在 4℃ 用抽提缓冲液抽提细胞 3~5 分钟。这一步去除组蛋白 H1 和除中间纤维蛋白之外的细胞骨架蛋白。另外,这一步也可在 DNA 酶消化步骤(第 4 步)之后作,这样也不会引起超微结构的变化。


抽提缓冲液:


10 mmol/L PIPES,pH 6.8


250 mmol/L 硫酸铵


300 mmol/L 蔗糖


3 mmol/L MgCl2


1 mmol/L EDTA


4. 在含 0.5% Triton X-100 的消化缓冲液中用无 RNA 酶的 DNA 酶消化以去除染色质 DNA 酶浓度为 200~400 单位/ml,32℃ 反应 30~50 分钟。


含 0.5% Triton X-100 的消化缓冲液:


10 mmol/L PIPES,pH 6.8


300 mmol/L 蔗糖


50 mmol/L NaCl


3 mmol/L MgCl2


1 mmol/L EGTA


5. 用抽提缓冲液清洗样品两次,每次 5 分钟。


6. (可选)样品在 4℃ 用 2 mol/L NaCl 抽提 3~5 分钟。这一步能使可能形成核基质核心的 10 nm 纤丝分支显形(Jackson and Cook 1988; He et al, 1990)。在第 4 步中用 Hae Ⅲ 和 Pst Ⅰ(每种酶 400 单位/ml)代替 DNA 酶 Ⅰ 可以使核心纤丝保存的更好。


2 mol/L NaCl 缓冲液:


10 mmol/L PIPES,pH 6.8


300 mmol/L 蔗糖


2 mol/L NaCl


3 mmol/L MgCl2


1 mmol/L EGTA


7. 固定核基质以进行免疫荧光检测或电子显微镜检测。


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