材料

本方法包括方案 8 中所有物品，加上：
甲酰胺（100%)

离子梯度胶用 1XTBE 配制，有无甲酰胺均可。关于含甲酰胺的聚丙烯酰胺凝胶，请见方案 9。

醋酸钠（3mol/L,PH7.0)

方法

1. 依方案 8 步骤 1~8。

2. 在实验桌的工作区上铺上衬塑料的保护纸。

3. 参照方案 8 或 9 配制变性聚丙烯酰胺凝胶。

4. 将胶放在电泳装置中。在上槽中加入 0.5XTBE 缓冲液，在下槽中加入 1 份 3mol/L 醋酸钠和 2 份 1XTBE。按照方案 11 操作。
电泳时，指示染料的移动逐渐变慢，当溴酚蓝到达底部时，移动几乎停止。一般，继续电泳直到二甲苯蓝离底部只有 5~10 cm 而溴酚蓝到了底部。
推迟加入 3mol/L 醋酸钠可以调整压缩 DNA 条带的时间。电泳开始时，上下槽都用 1XTBE; 在适当时候，在下槽加入一半体积的 3 醋酸钠。根据经验，这样可以压缩条带的不同区域，读出最多的条带。