该研究团队发展了一系列新的计算生物学方法和数据库，用于靶标发现研究。发展的反向分子对接方法及其服务器TarFisDock，现有来自50多个国家和地区800多个用户，许多理论预测新靶标获得了实验验证。作为TarFisDock的重要补充，PharmMapper在计算速度方面较反向对接方法有了明显的提高。基于该方法的靶标预测结果可以在数分钟至数十分钟内完成，为药物新靶标发现提供信息技术支撑，有力地促进药物靶标发现研究。目前，与国内外多家单位课题组合作，该研究团队已针对数十个天然产物进行靶标搜寻和实验验证，期望通过PharmMapper找寻到这些天然产物化合物的潜在作用靶标，明确其作用机理。
该研究项目得到了国家科技部、国家自然科学基金委及上海市科委的资助。
相关论文：Xiaofeng Liu, Sisheng Ouyang, Biao Yu, Yabo Liu, Kai Huang, Jiayu Gong, Siyuan Zheng, Zhihua Li, Honglin Li*, and Hualiang Jiang*. PharmMapper server: a web server for potential drug target identification using pharmacophore mapping approach. Nucleic Acids Res., 2010, 38, W609-W614.