1990年瑞士Ciba-Geigy公司的Manz和Widmer首次提出微全分析系统（Miniaturized total chemical analysis system，μ-TAS）的概念和设计，把微全分析系统的主要构型定位为一般厚度不超过5 mm，面积为数平方厘米至十几平方厘米的平板芯片（包括微阵列生物芯片和微流控分析芯片）。1994年始，美国橡树岭国家实验室Ramsey等在Manz的工作基础上发表了一系列论文，微流控分析芯片获得了重要发展。微流控分析系统是将常规CE的原理和技术与流动注射进样技术相结合，借助微机电加工技术的手段，在平方厘米级大小的芯片上刻蚀出矩形或梯形管道和具有其它功能的单元，通过不同的管道网路、反应器、检测单元等的设计和布局，实现样品的采集、预处理、反应、分离和检测，是一种多功能化的快速、高效、高灵敏度和低消耗的微型装置；是一个跨学科的新领域，其核心是将所有化学分析过程中的各种功能及步骤微型化，包括：泵、阀、流动通道、混合反应器、相分离和试样分离、检测器、电子控制及转换点等。

　　微流控分析系统可大大提高分析速度和极大地降低分析费用，微流控CE分析系统通常也被称为集成毛细管电泳（Integrated capillary electrophoresis，ICE）。微流控分析系统开创了分析科学历史的新篇章，使分析科学进入了一个微型化、集成化和自动化的崭新世界。