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代谢组学全流程解决方案

2020.5.18

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标记物验证的代谢组学不同层次的分析需求。

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代谢组学全流程工作流程

卓越的硬件方案

赛默飞的 Orbitrap 技术作为近 30 年来全新的一种质谱技术,其超高的分辨率、卓越的质量精度、优异的灵敏度、极佳的稳定性及与 QQQ 媲美的定量能力使其可以全面地迎接代谢组学的挑战,成为代谢组学研究强大的分析平台。

一、超高的分辨率

消除复杂基质的干扰,全面的检测代谢组  代谢组学分析的样品基质复杂,且需要在有限的分析时间内尽可能实现全组分的同时检测,而超高的分辨率对于分析那些基质复杂,干扰大的样品尤为重要。

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提供当前代谢组学前沿的研究领域代谢流组(Fluxomics)对于分辨率的超高需求  代谢流组通过对体内代谢物的标记,来实现有效的追踪代谢物在代谢网络中的流向和规律,是当今代谢组学研究的热点及前沿领域。在代谢流组的研究上,超高的分辨率更显的重要。

二、高质量精度

确保MS色谱峰每一个点的高质量精度  不同于一般的高分辨质谱,Orbitrap质谱平台基于其独特的原理及稳定性,可以确保色谱峰中每一个采集点都可获得小于1ppm的质量精度,确保代谢物元素组成的准确计算。

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同时提供 MSMS 小于1 ppm 的质量精度  Orbitrap质谱平台可同时提供 MSMS 小于 1 ppm的质量精度,这对确保代谢物结构的精细鉴定至关重要。

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三、与QQQ媲美的定量能力

一个平台即可实现非靶标定性/靶标定量分析的完美整合  Orbitrap质谱平台提供高灵敏、5 个数量级的动态范围及灵活多样的定量扫描模式,定性的同时具有极佳的定量能力。

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四、极佳的稳定性

满足代谢组学分析对于重现性的高度要求  Orbitrap质谱平台因其独特的结构及设计,提供代谢组学分析所需要的在质量精度、响应强度上的高重现性质谱数据,为组间的生物学差异比较提供可靠的基础。

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五、有效的正负离子切换扫描

提供大样本分析的高通量  Orbitrap质谱平台可以实现实时正负切换扫描功能,一次进样即同时获取正离子及负离子图谱,且不损失灵敏度和质量精度,可以大大提高代谢组学大样本分析的实验通量。

强大的软件方案

基于Orbitrap质谱平台采集的高质量原始数据,赛默飞提供全面、强大的软件平台实现对代谢组学的数据处理及生物信息学挖掘。

一、SIEVE 软件—专业的代谢组学数据处理、信息挖掘软件

• 独特的组分提取算法,综合考虑归属于一个代谢物的所有质谱离子响应;
• 精细同位素匹配算法,更准确判断代谢物元素组成;
• 主成分分析、T 检验等代谢组学统计模块;
• 与 KEGG 等多种常用代谢组学数据库相关联,可自动对差异成分进行搜库鉴定;
• Pathway Mapping。

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二、强大的数据库谱库及结构解析软件

 mzCloud—多级谱库及全未知代谢物结构解析;
• SIEVE 在 线 关 联 HMDB、KEGG 等常用代谢组学数据库;
• Mass Frontier 软件—自动质谱谱图结构解析软件,Fragmentation Library TM碎裂谱图库,涵盖了大于99%已发表的文献涉及的碎裂机理,可对化合物的碎片离子进行预测,特有的包含15万以上化学结构式及3万以上碎片图。

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三、TraceFinder 软件—高通量谱库检索及定量软件

• 建立谱图数据库,便于数据管理,并可对化合物进行搜库鉴定;
• 高通量目标代谢物筛查鉴定;
• 目标代谢物的高通量定量分析及热图;
• 定性筛查结果与定量方法的自动转化。

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基于 Orbitrap 超高分辨质谱平台的代谢组学全流程解决方案,可以提供当今代谢组学研究最优异的平台,在疾病生物标记物的寻找、食品组学、中医药等诸多领域全面迎接代谢组学研究的挑战。

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