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1. 安放好过滤架（保护滤器的夹子和夹子架（除非滤器架子有腿））。
2. 将出口与接受瓶（底部有出口的过滤接受容器）相连。
3.
将过滤器（如 90 mm
膜和可重复使用的过滤器支架，或一次性碟式过滤器或筒式过滤器）的出口放到合适的高度，使收集培养基的瓶子（培养基瓶，铝箔包裹，干热法灭菌）正好位于过滤器下方，瓶口可被钟罩盖住，并且当装满的时候可以很容易地将瓶子取出。如果需要，可先用一个无菌培养瓶进行调试，但最后不要用这个瓶子收集无菌液。
4. 将压力瓶与过滤器的入口连接起来。
5. 将培养基缓慢地倒入压力瓶（5〜50L）中。
6. 对于可重复使用的过滤器，要将泵（100 kPa (1 bar，15 p. s. i.)）打开足够长的时间，使滤器湿润。然后将泵关闭并拧紧过滤架。
7. 将泵打开调到 100 kPa (15 lb/in2 )。当接受容器（底部有出口的过滤接受容器）快装满时，打开管子（硅树脂耐压管）接到培养基储存瓶中。
8. 从过滤钟罩下取出瓶子盖好。
9. 将铝箔重新包在盖子（培养基瓶的盖子，高温高压灭菌）上，包到瓶颈处以保证保存时无尘。
10. 在瓶子上贴标签，标注日期，签名。
11. 根据过滤后收集瓶子的大小及数量，在过滤的开始阶段、中段、末段分别从瓶中取样品置于 37°C 孵育一周做污染检测。
12. 4°C 保存备用。质量控制完成前不要使用。
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