中国医学科学院蛋白质组学大会报告集锦
中国医学科学院肿瘤研究所徐宁志研究员作了题为《PTTG——促进食管鳞癌转移的癌基因》的报告，介绍了我国食管鳞癌患者的分布情况，PTTG过度表达对肿瘤转移的机理和促进作用，以及医学分析所面临的挑战。
中国医学科学院肿瘤研究所 徐宁志 研究员
食管癌是发生在食管上皮组织的恶性肿瘤，占所有恶性肿瘤的2%，我国是食管癌高发区，食管癌死亡者仅次于胃癌。垂体瘤转化基因( PTTG) 是一种新近发现的强有力的肿瘤转化基因，因其表达具有肿瘤特异性，因此被认为是一种极具潜在价值的肿瘤标记物，有可能成为肿瘤治疗的靶点。碱性成纤维细胞生长因子( bFGF) 是体内生物学功能较广泛的多肽因子之一，是广泛存在于人体内多种组织的一类多肽生长因子，在机体的胚胎发育、血管形成、创伤修复过程中起着重要的作用，与肿瘤的生长、侵润、转移和预后有密切关系。
PTTG作为癌基因，具有转化功能，调节bFGF 的表达，与bFGF协同参与肿瘤的发生、发展及侵袭过程。PTTG 和bFGF 在食管癌的发生、发展以及转移过程中起促进作用，而且二者有相互促进使肿瘤进一步发展，可能成为反映食管癌生物学行为及侵袭性的重要指标，针对PTTG基因及其表达产物的治疗，将为食管癌的基因治疗提供有效途径。当前，对PTTG与食管鳞癌的研究，仍然存在一些挑战，如修饰识别和定量分析等。
蛋白质组研究计划与疾病蛋白质组分析
中国医学科学院肿瘤研究所赵晓航研究员作了题为《蛋白质组研究计划与疾病蛋白质组分析》的报告，介绍了蛋白质组和蛋白质组学及其国际研究机构和研究进展，国际人类蛋白质组计划的相关情况等内容。
中国医学科学院肿瘤研究所 赵晓航 研究员
生命体的统一性源于基因组，生命体的复杂性、多样性、功能性源于蛋白质组，“基因功能”在很大程度上取决于所编码蛋白质的结构与功能。人类编码基因 20344个基因，编码蛋白5000个有强证据(不足1/3的基因有功能线索)，7000个弱证据，还有8000个没有证据。蛋白质组的表达水平不能从 mRNA表达水平预测，它能被修饰和加工，而这些作用与基因序列无关，而且能够动态反映生物系统的不同状态。“小鼠与蒙娜丽莎在基因组上的差别只有 1%”，RNA是遗传信息组合的关键部分，蛋白质是一切生命活动的基础，造就了生命的纷繁多姿，认识蛋白质组成及其功能网络是蛋白质组学的主要任务。
蛋白质组和蛋白质组学
蛋白质组(Proteome)是指一种基因组所表达的全套蛋白质，即一种生物、细胞或组织的全套表达蛋白，“Proteome”源于蛋白质(PROTEin)和基因组(genOME)两词的杂合。蛋白质组学(Proteomics)研究蛋白质组成及其功能网络的科学。蛋白质组学研究是功能基因组研究的重要部分：生物体中绝大多数蛋白质都是在相互联系、相互制约过程中形成复杂的蛋白质复合体和相互作用网络而发挥功能活性的;研究生物体在不同生长发育阶段、不同环境下、不同组织细胞中的蛋白质组改变;研究蛋白质结构、功能与特定生命现象的关系，从宏观上认识影响生命进程的规律。
一个独立生存的细胞生命至少需要多少个基因和表达蛋白?1995年，分离和鉴定了一种最小的能自我复制的生物，Mycoplasma genitalium的全部蛋白质(580kb;468ORFs)。Proteome的概念首次出现在科学刊物上。蛋白质组研究重要的里程碑事件：1994年Marc Wilkins提出了蛋白质组(Proteome)的概念;1995年悉尼大学Humphery Smith I等4家实验室共同分离和鉴定了Mycoplasma genitalium的蛋白质组;2001年国际人类蛋白质组组织(Human Proteome Organization，HUPO)宣告成立;2002年1rd国际人类蛋白质组大会启动“人类血浆蛋白质组(Human Plasma Proteome Project，HPPP)”和“人类肝脏蛋白质组计划(Human Liver Proteome Project，HLPP)”。
HUPO有13个国家和地区的57个实验室参与，首批执行计划的先期目标是a)比较样本收集、处理和储存过程对血浆蛋白质的影响;b)比较不同技术平台的优缺点、灵敏度和局限性;c)比较高丰度蛋白处理方法;d)比较数据提取、整理、存储和提交过程的标准化。最终目标是要实现a)全面认识人类血浆蛋白质组;b)揭示血浆蛋白质组在世界不同种族和不同国家的同一种族人群中的变异度;c)认识人类在特定时间和特定生理条件下血浆蛋白质组的改变;d)药物作用和疾病对血浆表达蛋白的影响等。
国际人类蛋白质组计划
国际人类蛋白质组计划(HPP)是继国际人类基因组计划之后的又一项大规模的国际性科技工程。首批行动计划包括由中国科学家牵头的“人类肝脏蛋白质组计划”和美国科学家牵头的“人类血浆蛋白质组计划”。“人类肝脏蛋白质组计划”的总部设在中国首都北京，这是中国科学家第一次领导执行重大国际科技协作计划。3年来围绕人类肝脏蛋白质组的表达谱、修饰谱及其相互作用的连锁图等九大科研任务，我国科学家已经成功测定出6788个高可信度的中国成人肝脏蛋白质，系统构建了国际上第一张人类器官蛋白质组“蓝图”;发现了包含1000余个“蛋白质-蛋白质”相互作用的网络图;建立了2000余株蛋白质抗体。
FDA和NCI联手合作，启动一项为期三年，投资300万美元临床蛋白质组计划，利用SELDI技术加速蛋白质组计划中癌症实验研究的临床应用。应用该模型对样品来自无癌、早期和晚期卵巢癌，以及良性疾病的妇女，进行盲法分析预测。结果50例卵巢癌的样品，被全部准确为肿瘤，其中包括18例I期病人;66 例非恶性肿瘤人群对照组中有63例确定为非恶性肿瘤。此结果表明，该方法的灵敏度为100%，特异性为95%，阳性预测值为94%。与此同时，将相同样品用CA125法进行检测，其阳性预测值为35%。据统计美国2002年约有74%卵巢癌病人发现在晚期，其五年生存率仅为29%。反之，在I期发现的病人中，则五年的生存率超过90%，其中许多病人仅通过外壳手术便获得治愈。因此，提高该病的I期诊断率，对于降低卵巢癌病人的死亡率和治疗费用，具有直接的作用。赵研究员还谈到了生物标志研发，蛋白相互作用平台，蛋白相互作用网络分析和蛋白芯片技术等问题。
研讨会期间还举行了抽奖活动，下图为抽奖活动现场：
