光合磷酸化的主要机制
1966年，Andre Jagendorf实验证明，即使在暗处叶绿体也可以形成ATP，只要在类囊膜两侧形成人为的pH梯度。即将叶绿体在pH4缓冲液中泡12小时，然后迅速与含ADP、Pi的pH 8缓冲液混合，叶绿体基质的pH迅速升至8，但是类囊体中的pH仍是4，这时发现随着类囊膜两侧pH梯度的消失，同时有ATP形成，所以提出与氧化磷酸化类似的光合磷酸化的化学渗透学说。
在光合磷酸化中也需要完整的膜，在光激发下H+从基质流向类囊膜内形成跨膜质子梯度。ATP酶是在膜外，形成ATP后后质子才流出去。
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