脊髓内脓肿的致病菌大多为金黄色葡萄球菌，少数为链球菌、肺炎球菌、大肠杆菌、真菌（如放线菌）等。曾发现绦虫裂头蚴导致脊髓内脓肿。感染原因和途径包括：

　　1.远处感染灶的血源性播散

　　可经动脉或静脉进入脊髓。临床上常继发于肺部、心脏（亚急性心内膜炎）、泌尿生殖系统、人工流产并发感染及体表皮肤化脓性感染等。脓肿可发生于任何脊髓节段，以胸髓背侧好发。

　　2.邻近感染灶的蔓延

　　在解剖上脊髓的蛛网膜下腔经脊神经与纵隔、腹腔、腹膜后间隙的淋巴管相通，因此感染可经淋巴管进入脊髓，伴或不伴脑膜炎。半数患者来源于腰骶部感染和尾部藏毛窦感染。脓肿大多发生在原发感染灶相邻近的脊髓。

　　3.创伤后感染

　　多见开放性脊髓外伤、腰穿等。

　　4.隐源性感染

　　指感染来源不明。

　　5.其他来源

　　少部分脊髓内脓肿是由于患者感染了HIV。