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科学家建立基于NGS的快速鉴定工业用基因和病原的新方法

2015.12.03

   德国弗朗霍夫界面工程与生物技术研究所(IGB)通过采用“下一代测序(Next-Generation Sequencing ,NGS)” 这一DNA高通量测序技术,建立了一种可以快速、准确鉴定工业用微生物基因和病原菌的方法,并在2015年10月 6日-8日汉诺威生物技术展(Biotechnica)上展示。

   IGB的研究人员采用NGS技术能在几个小时内完成对真菌Pseudozyma aphidis全基因组序列的分析,并将其中决定生物表面活性剂合成的基因准确鉴别出来,而该表面活性剂可用于生产洗洁剂和化妆品。采用新的NGS技术直接测序,不仅速度快,也可省去在实验室进行细菌培养的步骤,节省大量花费,这对生产沼气尤为有利。尽管沼气生产技术已经很成熟,但对其中涉及的微生物种类和生产沼气的途径至今仍未完全了解,IGB的研究人员采用NGS技术鉴定出200多种参与沼气生成的微生物种类及其在总的生物群落中的占比,以此可优化沼气生产设施,提高沼气产量,增强生产沼气这一可再生能源的农业企业在没有国家财政补贴的情况下同传统能源企业的竞争力。

   应用NGS技术的另一个具有发展前景的领域是传染病诊断。采用该技术,可以安全、准确、快速鉴定细菌、病毒和寄生虫等病原体。为了进一步开发应用这种疾病诊断技术,IGB的研究团队已经吸纳各大医院共同进行相关试验。

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