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荧光原位杂交及其在人类基因组研究中的应用(一)

2020.7.27

荧光标记的染色体原位杂交技术提供了一种快速而有效的手段,将DNA片断和特定的真核生物细胞的染色体区带联系了起来,并将这些DNA片断排序,这是研究 DNA顺序在染色体上位置的最直接的方法。最早,人们根据Gall和Pardue在1969年的工作,于70年代,建立起了同位素原位杂交技术,但当时只 是用于DNA顺序在多线染色体上的定位或是重复顺序在中期染色体上的定位。1981年,Gerhard和Harper等首先证明有可能将从个体基因中得到 的单拷贝顺序(SCP,single copy probe)通过同位素原位杂交技术定位到中期染色体上。在此基础上,80年代初起,荧光标记的原位杂交技术开始起步并得到运用且不断地发展。
 
1. FISH
技术简介
 
FISH技术包括下列几个步骤:a.探针的准备和标记;b.探针和染色体的杂交;c.信号检测;d.杂交信号与分带染色体的比较

 

1.1    探针的准备

 

探针的标记有两种。直接标记是将荧光分子直接渗入到探针分子中,以前这种方法用的不多,由于有北京少的优点,近来在一些公司的试剂盒中得到应用。

 

常用的间接法是将一些类似于半抗原(hapten)的标记分子渗入探针分子中,用的较多的试剂有生物素,地高辛(digoxigenin),二硝基苯(dinitrophenyl,DNP),汞和磺酸盐(sulfonate)。


就掺入方式来说,生物素,地高辛等是以核苷酸衍生物的形式掺入的,可用切口平移法来进行的,现在更多的人开始用随机引物法,用这两种方法标记好的探针大小在 200-500bp范围内,是用于杂交的最佳大小。另外,也可以在已知顺序的两个引物之间用PCR法来扩增,或从合适的载体上通过RNA转录而来。


1.2探针和染色体的杂交


最佳杂交条件取决于探针和目标的性质。已标记好的变性的探针(200-500bp)与变性的染色体在含有甲酸胺,盐和硫酸葡萄聚糖的杂交缓冲液中杂交过夜接着是柔和的洗涤,以去除未杂交或错配对的探针。




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