在“蛋白组学在临床科研中的应用”这一系列的文章中，我们分享了眼科、内分泌、心血管、神经等方面的研究思路。今天我们来介绍一个非常重要的，并且离不开蛋白质组学研究的一个学科——免疫方向的科研套路，哦不，是思路。

　　话不多说，满满干货！

　　第一篇， 强直性脊椎炎

　　杂志：Cts-Clin Transl Sci

　　时间：2015

　　IF: 1.052

　　摘要：这篇文章使用正常对照（9例）和患者（12例）的外周血单核细胞，利用iTRAQ技术做两组之间的差异蛋白比较分析。一共得到1232个蛋白，其中183个表达有差异。后续作者挑选CTSG， DFEA3，PTPRC和 PRDX1做Elisa验证。与对照组相比，CTSG，DEFA3和PTPRC的表达量都有显著升高，而PRDX1的表达量明显下降。文章的这些发现可能为研究强直性脊柱炎的发病机制提供新的思路。

　　思路：iTRAQ+Elisa

　　第二篇， 类风湿性关节炎

　　杂志：PLOS One

　　时间：2016

　　IF: 3.057

　　摘要：本文使用用药有反应的类风湿性关节炎患者（R组4例）与用药没反应的类风湿性关节炎患者（NR组4例）的血清样本。通过iTRAQ实验，共找到264个蛋白，其中有差异表达的只有9个。其中四个蛋白由于没有商业化抗体没有进行Elisa实验，其余五个均用Elisa试剂盒进行了验证。结果显示HPX在R/NR之间有显著的差异。血清中的蛋白可以作为用药指导的Biomarker。

　　思路：iTRAQ+Elisa

　　第三篇， 持续性过敏性鼻炎

　　杂志：Clin Exp Allergy

　　时间：2016

　　IF: 5.587

　　摘要： 本文使用45例持续过敏性鼻炎患者的血清样本作为实验组，20例正常人的血清样本作为对照。去除14种高峰度蛋白之后，作者使用iTRAQ技术寻找两组之间的差异表达蛋白。一共找到133种。通过Metacore数据库生信分析之后，转录因子ESR1，STAT1和STAT3被认为是非常关键的，其中STAT3可能与A2M的表达有关系。接着作者在血清中通过Elisa的方法验证了A2M的表达量，同时在鼻粘膜样本中，通过免疫组学得到A2M，ESR1，STAT1和STAT3的表达情况。通过一系列的实验，作者找到10条与过敏性鼻炎相关的通路，其中BC通路是最显著被调节的。通路中的A2M在患者中表达量很高。干预STAT3-A2M通路可作为今后过敏性鼻炎免疫反应中功能研究的方向。

　　思路：iTRAQ+生信分析+ELISA验证差异蛋白+免疫荧光/HE染色验证

　　第四篇， 银屑病

　　杂志：Immunity

　　时间：2013

　　IF: 24.082

　　摘要： 这篇文章样本来自患者的皮损处及非皮损处表皮，各19例。通过iTRAQ分组比较后，得出1217个蛋白，其中有表达量差异的有214个。其中以S100A8-A9上调最为显著，其次为C3。随后作者通过构建基因敲除鼠发现，S100A9基因敲除后，小鼠的银屑病程度减轻。同时，在体内干扰C3的表达量也能减轻病样表现。作者据此推测S100A9作为一个染色质成分，可能通过结合C3起始位点的上游区域来调节C3的表达。因此，S100A8-A9有望成为银屑病潜在的治疗靶点。[

　　思路：iTRAQ+生信分析+小鼠iTraq+免疫组化+免疫荧光+WB验证

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