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葛瑛:光解表面活性剂助力高通量蛋白质组学

2020.3.01

  2020年2月25日,继2019年在Nature Method [1]上发表文章后,威斯康星大学麦迪逊分校的细胞和再生生物学和化学系教授葛瑛(Ying Ge,相关链接:葛瑛教授研究团队)团队在 Angewandte Chemie Int Ed(2018 影响因子 12.257)上再次发表文章 [2]。摘要为:

  基于质谱(MS)的蛋白质组学为了解复杂生物中蛋白质的结构和功能提供了前所未有的机遇; 但是,质谱分析之前的蛋白质溶解度和样品制备仍然是阻碍高通量蛋白质组学的瓶颈。在此,葛瑛团队首次报道了由新开发的与质谱兼容的光可裂解表面活性剂:4-hexylphenylazosulfonate (Azo),4-己基苯基偶氮磺酸盐(Azo)[2]促成的高通量自下而上的蛋白质组学方法,该方法可促进蛋白质的强劲提取,30分钟快速酶解(相较于过夜的酶解法),然后在UV降解后进行后续的质谱分析。此外,葛瑛团队开发了一种由偶氮辅助的自下而上的方法,用于有效分析整体膜蛋白,这些蛋白是关键的药物靶标,但在全球蛋白质组学研究中尚没有得到很好的体现。此外,葛瑛团队证明了Azo作为自上而下和自下而上蛋白质组学的“一体式”质谱兼容表面活性剂的独特能力,适用于临床应用中高通量蛋白质组学的流水线式的工作流程。

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新型表面活性剂降低信号干扰 助力细胞膜蛋白质谱分析

  Key References:

  [1] Brown, K. A.; Chen, B.; Guardado-Alvarez, T. M.; Lin, Z.; Hwang, L.; Ayaz-Guner, S.; Jin, S.;Ge, Y. A Photocleavable Surfactant for Top-Down Proteomics,Nature Methods.2019, 16, 417-420.

  原文链接:A photocleavable surfactant for top-down proteomics

  [2] Brown, K; Tucholski, T; Eken, C; Knott, S; Zhu, Y; Jin, S;Ge, Y. High-throughput Proteomics Enabled by a Photocleavable Surfactant.,Angew Chem Int Ed 2020, Epub ahead of print.

  原文链接:High‐throughput Proteomics Enabled by a Photocleavable Surfactant

  相关链接:新型表面活性剂降低信号干扰 助力细胞膜蛋白质谱分析

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