结构域的分类

为了研究蛋白质分子结构的基本规律，人们用不同的方法从不同的角度对已知的蛋白质结构进行分类，有些是基于生物功能，有些是基于结构自身，有些是将二者结合在一起进行分类研究。例如，锌金属蛋白酶是一类可催化肽链内部肽键水解的肽链内切酶，尽管所属的各个亚家族成员的整体空间结构差异显著，但催化活性部位的结构非常类似，故将它们归属于一类蛋白。

然而，最为人们熟悉的还是M.Levitt和C.Chothia对蛋白质结构进行的分类。此方法认为二级结构的组合构成了大多数结构域结构的核心，并据此把蛋白质结构分为四类：α型、β型、α/β型以及其它类型的结构域结构。α型结构域结构主要由α-螺旋所构成，例如肌红蛋白的结构等。β型结构域结构主要由反平行的卜回折所构成，通常是两个卜回折相互包裹在一起，例如质体兰素的结构等。α/β型结构域结构则是由α-螺旋所包裹的以平行β-链为主的；β-α-β花样所构成的，例如丙糖磷酸异构酶、葡萄糖异构酶催化结构域的结构等。还有一些蛋白质是由不连续的α-和β-花样组合而成，并且通常在由α-螺旋包裹的结构域的一部分形成一个小的反平行β-回折，这些结构可以认为属于第四类，例如某些核酸酶的结构等。此外还有一些小的蛋白质，它们富含二硫键或金属离子，形成一个特殊的种类，这些蛋白质的结构似乎在很大程度上受金属离子或二硫桥的影响，所以看起来比常规的蛋白质显得无序。

类型有：α-螺旋型；α/β型；全β-折叠型；无规卷型。