新型微生物群体单细胞分辨率高通量空间转录组分析技术
近日，美国加州理工学院研究团队开发了一种新的高通量空间转录组成像方法——并行连续荧光原位杂交par-seqFISH（parallel sequential fluorescence in situ hybridization）技术，能够在单细胞水平鉴定和观察微生物基因表达谱和微尺度环境中的空间信息，同时利用成像系统对不同菌落核仁长度、染色体拷贝和核糖体水平等生长指标进行监测。
研究人员利用par-seqFISH对铜绿假单胞菌的生物膜形成过程进行了研究，证实其能够解析菌群在浮游生长状态下代谢和毒性相关基因转录水平的动态变化，以及固着生长过程（生物膜）中在空间水平上的代谢异质性，揭示了微生物种群在微环境空间中存在的复杂动态。研究结果表明par-seqFISH技术能够为微生物动态变化与生长调控机制研究提供了新的工具，并为抗菌药研发及抗生素耐药性研究提供新的视角。
相关研究成果发表在《Science》杂志上，论文标题为“Spatial transcriptomics of planktonic and sessile bacterial populations at single-cell resolution”
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