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pcr反应的一般程序与注意事项

2022.6.07

标准的PCR反应体系:10×扩增缓冲液
10ul
4种dNTP混合物
各200umol/L
引物
各10~100pmol
模板DNA
0.2ug
Taq
DNA聚合酶
2.5u
Mg2+
1.5mmol/L
加双或三蒸水至
100ul
PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特异性反应的关键,PCR
产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度.理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增.设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右.②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段.③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带.ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列.④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3’端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带.⑤引物3’端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败.⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处.⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性

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