上任伊始，美国国家医学院的一份报告呼吁彻查国家癌症研究所缺少效率、资金不足的临床试验合作小组;部分研究人员质疑“大生物学”项目的价值。如今，瓦穆斯所关心的最重要问题包括基因组、全球健康和挑战性研究问题。

　　2011年5月，国会将NIH2011年的预算在2010年的基础上削减1%，瓦穆斯宣布，因为正在履行更大的责任，削减经费是必要的，包括对现有经费项目3%的削减和癌症中心5%的削减。美国国家癌症研究所已经削减了8%的内部实验室，管理人员正在严格审查所有与这些项目相关的高质量申请项目，以便对这些项目按重要性进行分类。

　　瓦穆斯坚持认为，50亿美元的年度预算仍然让国家癌症研究所有发展新项目的余地。比如，研究所已指定1500万美元用于挑战性研究问题，内容包括为什么肥胖症会增加癌症风险、为什么少数种类的癌症更容易被治愈。

　　为了提高管理能力，瓦穆斯将内部和外部的基因组项目合并为一个单独的中心，包括癌症基因组图谱。他接受国家医学院的建议，将国家癌症研究所的9个临床试验小组合并为4个。今年春天，他将部门负责人詹姆斯提升为副所长，主管临床和转化研究;目前，他正在为国家癌症研究所癌症预防部门和新成立的全球中心寻找负责人。