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使用冷冻分装技术提高粪便微生物菌群研究的效...(二)

2020.6.15

使用冷冻分装技术提高粪便微生物菌群研究的效率和质量:突破处理粪便样本难题


冷冻样品取样技术介绍

 

任何肠道微生物研究工作的起点都是从患者和志愿者那里收集粪便样本,收集方法会根据操作流程和容器的不同而有所差异。考虑到研究项目的性质、规模以及存储要求,样本会被保存为原始状态或者进行悬浮处理。考虑到收集容器的类型和采集后的样本制备,冷冻样品取样技术能够处理大部分类型的冷冻粪便样本规格。CXT350冷冻样品取样仪擅长处理大多数类型的样品收集容器,从2.0毫升小型冻存管到50ml的大型离心管,都可以快速进行设置,以适应当目前种规格的管型。CXT750冷冻样品取样仪可以实现完全自动化的冷冻样本处理,适用于分析通量要求更高的作业环境。如果在样本收集时或者收集后立即对样本进行悬浮化或标准化处理,CXT 750将在标准化工作流程和集中存储的实施过程中,成为强有力的实验工具。

 

一般而言,冷冻粪便样本可以根据需要随时进行提取样,而母样则始终保持在冷冻状态(以供日后研究)。另外一种办法是,根据预先计划的研究项目需要或样本库建立/规格重排的需要,母样本可直接被冷冻取样等分为若干数量的子样本,方便日后使用。

 

该方法仅在无需对母样本进行保留时使用。

 

无论是否采用冷冻取样方法,在没有多次的反复冻融的情况下,冷冻取出的样本都可直接用于大多数核酸提取工作。法国农业科学研究院的研究人员近期通过冷冻取样技术,验证了这一技术在粪便/肠道微生物研究领域的作用(参见图1)。法国农业科学研究院将冷冻取样技术与之前的取样方法进行对比,进一步研究这一新技术是否适用于他们拟实施的研究项目。

 

结论

 

经大量研究证实:我们的肠道菌群与健康、疾病之间存在着复杂的相互关联,所以,肠道微生物组研究的重要性正变得越来越明显。由于越来越多的证据可以证明:不同的肠道微生物菌群的形态与诊断、预后之间存在着极强的相关性,甚至是因果关系,科学家们因此也越加关注这一领域的研究。因此,涉及人类粪便样本采集和分析的研究越来越多,规模也越来越大。目前,在人体肠道微生物菌群的研究中,想要有效和安全地处理大量半固态或悬浮态粪便样本,冷冻样品取样技术是唯一可行的解决方案。

 

1该资料和数据由法国农业科学研究院(INRA )MetaGenoPolis项日的Joel Dore博上提供。

 

CXT350冷冻样品取样仪

 

● 利用一次性取样针,以半自动取样和分装冷冻样;

 

 ● 维持原始样本和取出的样本在超低温(< -130℃)冷冻状态,消除令人不悦(粪便)气味的同时,最提高科学研究的效拘安全性;

 

 ● 适用于方法开发和小规模究。

 

 

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可容纳并处理市面上大部分的样品管规格,亦可根据需要进行定制,最大限度地提高了在实际应用中的灵活性。

 

通过消除反复冻融的操作,保持活体微生物遗传图谱特性。

 

冷冻取样技术可整合到基因组研究的工作流程中,提高研究效率,最大限度地提高样本存储率。

可对原始样本进行重复取样,无需进行反复冻融即可满足对样品进行冷冻分装的需求。

 

 

CXT750冷冻样品取样仪

● 以全自动方式取样和分装冷冻样本。 

 

● 维持原始样本和取出的样本存超低温(-80℃)冷冻状态,在消除令人不悦的(粪便)气味的同时,最大限度地提高科学研究的效率和作业的安全性。

 

● 适用于大型群组样本研究,样本库的收集组合、合并和规格重排工作。

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SBS标准的样品管架系统,兼容从2 0rnl冻存管到1 4ml  96矩阵规格等多种样品管类型,同样可以根据客户的需要进行定制。


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