治疗的目的是：减灭和消除病灶，缓解并解除疼痛，改善和促进生育，减少和避免复发。治疗时主要应考虑的因素为：年龄、生育要求、症状的严重性、病变范围、既往治疗史以及患者的意愿。治疗措施要规范化与个体化。对盆腔疼痛﹑不孕以及盆腔包块的治疗要分别对待。治疗的方法可分为：手术治疗﹑药物治疗﹑介入治疗﹑以及辅助生育治疗等。

　　一是抓住早期治愈，二是控制子宫内膜异位症发展，三是防治愈后复发。

　　子宫内膜异位症的治疗方法很多，有手术治疗，西药及中药治疗。

　　西药治疗子宫内膜异位症：多为以假孕疗法为基础。

　　中医中药治疗子宫内膜异位症：具有缓解疼痛、调经助孕、改善症状等显著疗效，同时通过对内分泌、血液流变学、生殖、前列腺素合成于代谢及免疫等方面进行调节，改善生殖系统的功能，以达到提高受孕率的目的。

　　手术治疗治疗子宫内膜异位症：在直视下可以基本上明确病灶范围和性质，对解除疼痛，促进生育功能效果较好，疗程短尤其对重症者，纤维化多，粘连紧密，药物效果不明显。较大卵巢内膜样囊肿，药物治疗无效，手术尚有可能保留有效卵巢组织。可采用在腹腔镜下还可行输卵管通液检查。手术方法有多种，具体根据患者的具体病情。