进行琼脂糖凝胶电泳所需的设备和用品相对简单，包括：电泳仪和电源

　　凝胶浇铸托盘，有各种尺寸，由紫外线透明塑料制成。在浇铸凝胶时，用胶带封闭托盘的开口端，然后在电泳之前将其除去。

　　样品梳子，将熔融的介质倒在梳子周围，以在凝胶中形成样品孔。

　　电泳缓冲液，通常是Tris-acetate-EDTA（TAE）或Tris-borate-EDTA（TBE）。

　　上样缓冲液，其中包含一些稠密的物质（例如甘油）以使样品“掉入”样品孔，以及一种或两种跟踪染料，它们在凝胶中迁移并可以进行可视监控或电泳进行了多远。

　　染色：当在非本征氟乙锭存在下进行电泳时，在紫外灯下很容易观察到DNA分子。或者，可以在电泳分离后通过将凝胶浸入溴化乙锭溶液中对核酸染色。当插入双链DNA中时，该分子的荧光大大增加。也可以用外部氟1-苯胺基-8-萘磺酸盐检测DNA。

　　Transilluminator（紫外线灯箱），用于可视化凝胶中的染色DNA。