Illumina斥资12亿美元收购PacBio 加速基因测序行业整合
2018年11月1日，Illumina公司宣布收购Pacific Biosciences公司。Illumina将以后者每股8美元的价格以全现金交易的形式收购该公司。这一价格比Pacific Biosciences在2018年10月31日市场收盘时的30个交易日成交量加权平均股价溢价71%，按完全稀释口径计算，企业总价值约为12亿美元。
据悉，该协议已获Illumina和Pacific Biosciences董事会批准。此次交易还须经Pacific Biosciences股东的批准，并符合常规成交条件，包括适用的监管批准。Illumina预计此次交易将于2019年中期完成。
这也是Illumina近年来最大手笔的收购项目。
整合短读长与长读长
Illumina方面称，此次收购以准确的长读长测序能力进一步完善了Illumina的测序解决方案，有利于解答一系列复杂的基因组问题。
Illumina是测序行业巨头，其平台专注于短读长测序技术，可以满足大多数测序应用需求。Pacific Biosciences所拥有的长读长技术将帮助在某些特定的应用中提升能力，例如从头测序及基因组高度同源区域的测序。通过收购Pacific Biosciences，Illumina将能够提供整合的工作流程并推动创新，将这两种技术结合起来，帮助研究人员更快地推进研究项目，并使临床医生得以更经济地开展新的检测。
“PacBio无以伦比的准确性可与Illumina在短读长测序中的高准确性相媲美。两种技术的结合让我们可以触及到更多应用，让基因组发现变得更快，推动我们创新的能力，而这恰是Illumina自成立以来的基石，”Illumina公司总裁兼CEO Francis deSouza说，“PacBio不懈追求改善测序准确度，同时降低成本，这凸显了长读长将测序技术扩展至新客户和应用领域的潜力。”
“Illumina公司持续以前所未有的速度普及测序技术的应用。通过此次并购，如今大量研究人员将能够直接使用这项技术，”Pacific Biosciences公司CEO Michael Hunkapiller博士说。“Illumina和Pacific Biosciences拥有共同的价值观和对创新的承诺。我们互补的测序技术在整合以后将为客户提供对基因组更高层次的见解，为基因组应用打开新的天地。”
Pacific Biosciences此前曾被看作是Illumina的竞争对手，其产品基于全新的单分子实时（SMRT®）测序技术，能够完成从头基因组组装，从而更加全面地识别、注释和破译基因组结构；进行全长转录组分析，改善参考基因组的注释，描绘重要基因家族中的选择性剪接异形体并发现新型基因；开展靶向测序，更全面地描绘遗传变异；提供表观基因组表征的实时动力学信息。Pacific Biosciences的技术提供高度准确的超长读长，均匀覆盖以及同时检测表观遗传变化的能力。包含耗材及软件的PacBio®测序系统基于SMRT测序技术提供简单、快速、端到端的工作流程。
肿瘤治疗精准化
此次收购因此也代表了Illumina在基因测序行业的整合能力，新产品、新合作愈发多元多样化。
此前两天，10月30日，Illumina宣布推出TruSight™ Oncology 500（TSO 500）panel，这是一个全面的全癌种检测试剂盒，旨在鉴定已知和新发现的肿瘤标志物。
由于基础研究的进步和新技术的加持，肿瘤研究、诊断和治疗在近年来趋向于精准化和个性化，也反向推进测序技术朝着这个方向发展。
TruSight Oncology 500利用受试者肿瘤样本中的DNA和RNA来鉴定影响肿瘤进展的关键体细胞变异，如小的DNA变异、融合和剪接变异。更重要的是，TruSight Oncology 500能够测定肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI），这些指征有望成为日益得到推广的免疫疗法的关键指标。
TruSight Oncology 500仅供科研使用，将在2019年第一季度上市。
肺癌的分子检测一直处于精准肿瘤学的前沿。一些患者使用靶向疗法取得了良好的结果，目前使用靶向疗法前需要检测多种生物标志物，如EGFR突变、ALK融合和ROS融合等。
最近，TMB作为生物标志物逐渐兴起，经证明TMB分值高的患者对免疫检查点抑制剂表现出更好的响应和更长的存活期，这使得全面测序变得更加必要。
在肿瘤单一样本流程中可靠测定TMB，需要对大约1Mb或更大的区域进行测序，开展特异且灵敏的变异检出，以及利用生物信息学方法来标记和去除生殖系变异。为了全面了解并制定最佳治疗方案，所需的生物标志物数量不断增加，TruSight Oncology 500（目前市面上最大最全面的panel之一）这样的检测涵盖了所有的生物标志物。
“肿瘤突变负荷作为预测免疫检查点抑制剂反应的生物标志物，在非小细胞肺癌治疗中的重要性不断提升，”德国海德堡大学医院的病理学家Albrecht Stenzinger博士表示，“然而，体细胞标记的检测，如ALK融合和小的EGFR变异，也同样重要。使用DNA和RNA的TSO 500流程让实验室能够评估TMB，并同时评估小的DNA变异和融合，最终节约时间，并节省珍贵的样本。”
“最近出现了许多测定TMB的方法，但这些方法的变异检出性能及其基因内容都有所不同，这影响了检测结果，”德国科隆大学病理学研究所的分子生物学家Carina Heydt博士说，“作为TSO 500的早期试用者，我们实验室发现该试剂盒不仅很容易操作，而且基于富集的检测试剂与革新的生物信息学工具相结合表现出很高的变异检出性和TMB测定可重现性。”
Illumina近期合作的制药公司和医疗保险机构正在转向更深度、更广泛的测序，以帮助预测哪些患者将受益于新型疗法，包括免疫疗法、靶向疗法和许多有潜力的组合。近日，百时美施贵宝和Illumina宣布了一项合作，将基于TruSight Oncology 500开发并在全球推广伴随诊断，以支持百时美施贵宝的肿瘤学产品组合。
“通过专注于我们最独特的肿瘤学产品，我们能够满足客户的需求，并提供全面的NGS panel，它包含与靶向和免疫疗法相关的所有已知和预期的生物标志物，”Illumina临床基因组学的执行副总裁Garret Hampton说。“随着我们未来推出通过监管批准的体外诊断版本试剂盒，我们将能够为准确而可重现的检测设定标准。今天TruSight Oncology 500不仅在检出TMB上的能力符合当前的研究和新兴指南，而且它还为未来生物标志物的鉴定带来希望，使其成为这个快速发展领域的强大解决方案。”
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