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为什么MALDI 图谱中都是相差 44Da 的峰,肽段的峰则全被...

2020.7.21

为什么MALDI 图谱中都是相差 44Da 的峰,肽段的峰则全被抑制了?


相差 44Da 的峰可能是 Triton X 峰 ,也可能是 polymer ( -CH2CHOH- )峰。这些 polymer 是从 EP 管的内壁沥滤( leaching )出来的。所以 样品中不能含有 Triton X 。 另外实验中不能使用加有可塑剂( plasticizer )或塑料软化剂的离心管(比如 PCR 管)来装取样品。最好是使用进口 EP 管。另外,可以用 60 %的乙腈 /0.1%TFA 去清洗 EP 管的内壁以防沥滤。清洗后,要等到残留液都挥发( air dry or speed vac )后再装样品。 此过程中要注意不让杂质灰尘落入管内。 另外,试验操作过程中所佩戴的塑胶手套也可能有可塑剂。所以一定要佩戴无尘的手套。每次用手打开或触摸盛有样品的 EP 管时,一定注意不要碰到 EP 管盖的内壁。开盖时,可以使用 Eppendorf 枪上的金属拉杆(动作如开啤酒瓶盖儿)。从冻干机中取出 EP 管时,最好拿在盖子和管子的连接部分或盖子的突出部分。胶的染色和脱色中,尽量不要触摸胶(即便是带了手套)。可以用厨房用的铲子(带镂空的那种,超市里有卖)来操作。

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