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逆转录聚合酶链反应的操作步骤

2022.11.11

1. 总RNA的提取:见相关内容。

2. cDNA第一链的合成:试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScript Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。

(1)在0.5ml微量离心管中,加入总RNA 1-5μg,补充适量的DEPC H2O使总体积达11μl。在管中加10μM Oligo(dT)12-18 1μl,轻轻混匀、离心。

(2)70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。

然后加入下列试剂的混合物:

10×PCR buffer 2μl

25mM MgCl2 2μl

10mM dNTPmix 1μl

0.1M DTT 2μl

轻轻混匀,离心。42℃孵育2-5min。

(3)加入SuperscriptⅡ1μl ,在42℃水浴中孵育50min。

(4)于70℃加热15min以终止反应。

(5)将管插入冰中,加入RNase H 1μl ,37℃孵育20min,降解残留的RNA。-20℃保存备用。

3.PCR:

(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:

第一链cDNA 2μl

上游引物(10pM) 2μl

下游引物(10pM) 2μl

dNTP(2mM) 4μl

10×PCR buffer 5μl

Taq 酶(2u/μl) 1μl

(2) 加入适量的ddH2O,使总体积达50μl。轻轻混匀,离心。

(3) 设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。

(4) 电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。

(5) 密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。


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