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逆转录聚合酶链反应的注意事项

2022.11.11

1. 在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。

2. 为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。

3. 内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差。

4. PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定。

5. 防止DNA的污染:

(1) 采用DNA酶处理RNA样品。

(2) 在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。


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