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原位PCR实验步骤

2019.3.02

原位PCR实验步骤,原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。


一、组织切片和细胞样品的制备


试剂与配置


10%福尔马林;二甲苯;PBS


操作方法


1. 用10%福尔马林固定组织8~15hr,石蜡包埋,切片(4μm),将切片置于新鲜的二甲苯中处理5min,放入无水乙醇中浸泡5min,取出,空气干燥;


2. 对于培养细胞,可直接制备爬片,也可有PBS洗细胞一次,加10%福尔马林静置,用橡胶刮下细胞;用PBS洗细胞两次,2000rpm×3min,用5ml PBS重悬细胞,即可用甩片机甩片或直接吸50μl点在载玻片上。


二、切片预处理(蛋白酶消化)


试剂与配置


0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)


缓冲液A:0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4),0.3% Tween-20,0.5% NP-40


蛋白酶K:20-50μg/ml,溶于TE中


原位PCR实验步骤,操作方法


1. 干燥后的切片置于0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)中,室温孵育5min;


2. 浸入缓冲液A中,室温孵育10min;


3. 滴加20μl蛋白酶K液于标本上,在湿盒中37℃孵育20min;


4. 在室温下,用0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)漂洗两次,每次5min。


三、原位扩增(以标记生物素为例)


试剂与配置


PCR反应缓冲液:两种引物各100pmol,dATP、dCTP、dGTP和dTTP各200μmol, Bio-dUTP 50mol,1×PCR缓冲液;


Tag酶:5U/μl


缓冲液B:0.01mol/L PBS,0.1% Triton-X100


指甲油(市售)


无水乙醇


原位PCR实验步骤,操作方法


1. 切片用1×PCR缓冲液平衡3次,每次5min;


2. 用滤纸吸去切片上多余的液体,置60℃,每片加入30μl PCR反应缓冲液,5U Tag酶,用盖玻片封片,四周封以指甲油,防止蒸发;


3. 94℃变性5min,按下列条件(94℃×2min,55℃×2min,72℃×3min)循环20~25次后,72℃延伸5min;


4. 玻片浸入无水乙醇中10min,以软化指甲油;


5. 用刀片撬开盖玻片并除去;


6. 用缓冲液B漂洗两次,每次3min;


7. 用无水乙醇固定5min,并吹干。


四、检测(以ABC法为例)


试剂与配置


缓冲液C:0.1mol/L Tris-HCl (pH7.5),0.1mol/LNaCl,2mmol/L MgCl2, 0.5% Triton-X100


封闭液:3%BSA(溶于缓冲液C中)


显色液:0.05%DAB,溶于0.05mol/L Tris-HCl (pH7.4),临用前每10ml加30%过氧化氢50μl


1%盐酸酒精液


苏木素染色液


操作方法


1. 用30μl 3%BSA滴加在玻片上,封闭1hr;


2. 用缓冲液C简洗1min,每片滴加ABC复合物20~30μl,室温放置40min;


3. 缓冲液B室温漂洗3次,每次15min;


4. 滴加显色液于玻片上,镜下观察控制显色时间(一般7~14min);


5. 流水洗片,浸入苏木素液中复染30s,1%盐酸酒精分化(提抽2次);


6. 常规脱水、透明、封片,镜下观察。


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