KAPA HyperChoice探针在200Mb的人类基因组区域定制的应用

KAPA HyperChoice / KAPA HyperExplore 定制设计

KAPA HyperChoice探针支持高达200 Mb的人类基因组区域定制， KAPA HyperExplore探针支持高达200 Mb的非人类基因组或复杂区域的定制。罗氏久经验证的专有算法，加上我们在探针排布和设计领域近20年的经验积累，能帮您解锁基因组困难区域。结合优化的KAPA HyperCap工作流程V3.0，KAPA靶向富集探针可大大提高捕获均一性，并减少有效识别基因组变异所需的测序数据量。

精益设计

高性能KAPA靶向富集探针，快速、高效地覆盖目标区域

• 依靠罗氏专有算法和久经验证的探针排布及设计，改善目标覆盖度，提高测序效率，使样本数据利用最大化。

• 支持上传基因名称和bed文件，手动输入基因组坐标，或从常用基因名列表中进行选择。

罗氏设计专家在线指导和支持

• 有关您的特殊设计需求或非人类物种定制，罗氏专业设计团队将为您提供专属服务。我们的设计专家将倾听您的需求， 以优化您的探针设计和选择。

仅需几步，理想设计唾手可得

• 罗氏的专业设计能力、卓越的高保真探针合成工艺、优化的KAPA HyperCap工作流程，是您从第一次设计开始就能体验到的高品质产品与服务。

KAPA HyperChoice / KAPA HyperExplore 定制设计探针

• 使用KAPA高保真聚合酶合成，经罗氏专有算法设计。

• 基于NGS方法的质量控制体系，保证质量稳定。

• 更高的均一性和更低PCR重复率，达到更好的目标区域覆盖

图1. 未经优化的KAPA靶向富集探针，性能已然优于SeqCap EZ Prime探针。对比试验中，两种方法均依照各自的标准HyperCap Workflow操作指南，样本使用coriell DNA。每个捕获反应混合8个DNA文库，并根据panel大小在MiSeq系统上以2 x 100 bp测序。为了同等比较两种不同技术的性能，HyperChoice Panel根据SeqCap EZ Neurodegenerative进行设计，但并没有像SeqCap EZ panel那样经过优化。结果表明，KAPA HyperChoice探针以更高的均一性和更好的目标区域覆盖度超出SeqCap EZ版本探针。

在NovaSeq6000系统测序，结果显示出非常低的PCR重复率，高均一性（Fold80低）和高目标区域覆盖（≥30X碱基覆盖率）。两种设计均按照KAPA HyperCap Workflow v3.0，样本为100 ng NA12891 DNA。数据指标为6个重复，单样本捕获的平均值