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TEM-105编码基因的克隆与原核表达

2021.4.27

由于一种细菌可同时产生多种β内酰胺酶,因此为了避免多种β内酰胺酶的相互干扰,我们应用肉汤稀释法对产超广谱β内酰胺酶( ESBLs )的 4 株肺炎克雷伯菌( Kpn )的 TEM 型编码基因进行了原核表达。

一、 材料和方法

1. 菌株来源和表型鉴定: 4 株临床菌株 No95 、 No96 、 No102 、 No106 为浙江省台州第一医院内科患者痰标本分离的 Kpn 。经抑制剂增强的肉汤稀释法证实为阳性。

2. 细菌质粒 DNA 提取与 PCR 扩增:采用碱裂解法提取质粒 DNA 。根据 TEM-1D 编码基因序列设计的 TEM 引物序列为 5' -TTAGACGTCAGGTGGCACTT -3' ( 76 ~ 95 )和 5' -GGACCGGAGTTACCAATGCT -3' ( 1065 ~ 1084 ),由上海生物工程公司合成。 PCR 反应参数同前。设大肠埃希菌?( Eco ) ATCC25922 、标准产酶 Eco ( TEM-26 )作对照。

3. PCR 产物的纯化、克隆:按照 PCR 产物纯化 kit ( QIAgen )的要求,纯化目的片断,取 3μl 与 pGEM-Teasy Vector(Promega) 连接。连接反应液转化至 EcoDH 5a 感受态细胞,经含氨苄西林( Amp50μg/ml )的麦康凯培养基筛选。挑取白色菌落,接种于含 Amp 的 LB 培养液中, 37 ℃ 培养过夜。经 EcoRI ( Takara )酶切鉴定。

4. 核苷酸序列测定及分析:以重组菌双链质粒为模板,按 Sanger 双脱氧末端终止法,于 Pharmacia 公司 ALF 自动测序仪进行双链测序,结果在 GenBank 网上查询。

5. 接合试验:按照 Jacoby 等的方法进行,其中 EcoC600 ( Str r ,即链霉素抗性)为质粒接和试验的受体菌。

6. 原核表达:分别加入 pET -28c 3 μl 、目的 DNA 3 μl 、 2 × Buffer5μl 和 T4 连接酶 2μl 于 0.5ml 的 Eppendorf 管中, 37 ℃ ,过夜。上述连接产物转化于 EcoDH 5a 感受态细胞中,用的含卡那霉素 40μg/ml 的麦康凯培养基平板进行筛选。

7. 表达鉴定:挑取白色菌落置于含 Amp 的 LB ( 50μg/ml )液中, 37 ℃ 振荡过夜培养。碱裂解法提取质粒,并用 PCR 进行表达鉴定。

8. 表型鉴定:用 ESBLs 浓度梯度法进行表型鉴定。

9. 等电点( pI )测定:超声破碎获得酶的粗提液。按照 PhastSystem 电泳仪说明书和 Pharmacia Biotech 凝胶要求进行,电泳后,用头孢硝噻吩染色,标准蛋白用考马斯亮蓝 R-250 染色,用 CurveExpert1.3 软件计算 pIs 。

二、 结果

1. 接和试验: 4 株临床菌株结果均为阳性,其相应接合子分别为 C95 、 C96 、 C102 和 C106 。碱裂解法提取质粒,并用 TEM 引物进行 PCR 扩增,结果显示:临床菌株和相应接合子的质粒在 1009bp 处均可见到一电泳条带,与标准菌株( TEM-26 )的扩增片段大小一致,而 C600PCR 扩增结果为阴性。表明这种 TEM 型 β内酰胺酶的基因位于质粒上。

2. 基因型鉴定:用 TEM 引物对 4 株临床菌株进行 PCR 扩增,其结果均为阳性,其片段大小近 1009bp ,与标准菌株( TEM-26 )的扩增片段大小一致,而空白对照和 EcoATCC25922 的结果为阴性。这些片段经序列分析,结果显示: 4 株细菌的序列均为 1009bp ,与广谱酶 TEM-1 相比较,其序列有 6 个位点的改变,即第 124 位、第 8 位、第 48 位、第 134 位、第 160 位和第 242 位( gga → ggg ),相应的氨基酸只有第 124 位的丝氨酸变为天冬酰胺。我们首次登录 GenBank ,并被命名为 TEM-105 。

3. TEM-105 的特性研究:用 ESBLs 浓度梯度法进行鉴定,标准产 TEM-26 菌株的原核表达菌为阳性,而 4 株临床菌株的 TEM 型基因的原核表达菌均为阴性,表明 TEM-105 为非 ESBLs 。等电聚焦电泳结果显示该酶的 pI 为 5.4 。

三、 讨论

本研究的,标准菌株( TEM-26 )经 TEM PCR 扩增后的目的片段,与 pET -28c 连接后,可成功地在 EcoDH 5a 感受态细胞中表达,这表明原核表达用于某种 β内酰胺酶的研究是可靠的。此外,质粒接合试验证实了其耐药基因位于质粒上。这表明,尽管由于点突变未引起β内酰胺酶活性部分的空间构象改变,所以未引起酶性质的改变。

通过对 KpnTEM 型 编码基因的研究,在世界上首次报道了 TEM-105 ,并证明其为广谱酶性质。


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