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赛默飞世尔科技精彩亮相第六届AOHUPO大会

2012.5.09

　　2012年5月5~7日，第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会在国家会议中心卡隆重召开，这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。赛默飞世尔科技作为此次大会的金牌赞助商，展示了其蛋白质组学领域的最新产品技术及解决方案。

赛默飞世尔科技展台

大会入口处摆设了赛默飞产品宣传旗

　　在6日中午举办的午餐招待会期间，来自赛默飞世尔科技蛋白质组学市场总监Andreas FR Huhmer博士为大家详细介绍了赛默飞高性能质谱对生物研究领域的影响。

午餐招待会现场

赛默飞世尔科技色谱质谱产品中国区高级商务总监杜平先生

　　首先，赛默飞世尔科技色谱质谱产品中国区高级商务总监杜平先生在首先对赛默飞世尔科技在中国的整体情况进行了简单的介绍。

　　目前，赛默飞世尔科技在中国拥有215,000平方英尺的厂房，1,900名员工，超过1000名专业技术人员服务用户，在中国设有8家销售办事处，5家应用中心。2010年在上海成立了首个赛默飞世尔中国技术中心。赛默飞世尔科技在中国制造的产品包括科学仪器、环境仪器、过程仪器以及实验室产品，应用于医疗保健、生命科学、环境、食品安全和工业领域。2012年，赛默飞世尔科技在苏州科技城投资9000万美元新建工厂，该工厂将建设成为亚太地区最大的、能够同时生产包括各类酶标板、细胞培养用品等实验室耗材，以及二氧化碳培养箱、超低温冷箱和离心机等实验设备的基地。

　　最后，杜平先生总结到：赛默飞世尔科技将最大化您的实验室生产力，帮助解决您的分析难题，提供无以伦比的实验室产品和技术服务。

赛默飞世尔科技蛋白质组学市场总监 Andreas FR Huhmer博士

　　赛默飞世尔科技蛋白质组学市场总监Andreas FR Huhmer博士介绍了题为《高性能质谱对生物研究领域的影响》的报告。

　　Andreas FR Huhmer博士首先为大家回顾了赛默飞世尔科技质谱的发展历程。1999年提出了Orbitrap质量分析器的概念；2005年推出了首台商业化的LTQ Orbitrap质谱；2008年推出集成Orbitrap技术的Exactive新型台式LC-MS系统；2009年推出了LTQ Orbitrap Velos轨道阱质谱仪；2011年ASMS上相继推出了Velos Pro双压线性离子阱质谱、Q Exactive高性能台式四极杆-轨道阱质谱仪和Orbitrap Elite高场轨道阱组合质谱仪这三款新品。

　　Orbitrap傅立叶变换电轨道场质量分析器的原理包括：电轨道的离子捕获，镜像电流检测技术，高场轨道阱，和外部的脉冲离子源。2011年新推出的质谱将Orbitrap质量分析器进行了改进，首先将Orbitrap体积缩小，增强了傅立叶变换技术，增加C-Trap中可进行离子聚焦和发射。使得分辨率高达240,000FWHM，最大扫描速度达10spectra/sec，同位素分辨率的质量上限达50kDa。

　　基于质谱技术蛋白质定量方法

　　SILAC技术——质谱定量分析蛋白质

　　SILAC技术的基本原理是分别用天然同位素(轻型)或稳定同位素(重型)标记的必需氨基酸取代细胞培养基中相应氨基酸，细胞经5-6个倍增周期后，稳定同位素标记的氨基酸完全掺入到细胞新合成的蛋白质中替代了原有氨基酸。不同标记细胞的裂解蛋白按细胞数或蛋白量等比例混合，经分离、纯化后进行质谱鉴定。

　　同位素标记

　　串联质谱标记(TMT)方法能够分析一个样品的每一个单独的蛋白，可同时最多分析6个样品。半胱氨酸串联质谱标签（cysTMT）试剂可以富集和定量分析含有半胱氨酸的肽段。

　　Q Exactive：重新定义了定性/定量的工作流程

　　Q Exactive系统重新定义了定性/定量的工作流程，可分析复杂基质中的痕量代谢物、污染物和多肽。它具有新的称之为“Quanfirmation”的功能，可在一次分析中同时完成化合物的鉴定、定量和确证分析，并具有高达140,000FWHM的分辨率。

Q Exactive质谱系统的内部结构

　　采用多重SIM模式定量分析复杂基质中的蛋白质，第一步在四极杆中选择目标母离子，第二部离子在 C-Trap中进行聚焦，通过前两步可使离子在进入Orbitrap质量分析器之前进行反复的累加；第三部经过累加后的离子进入到 Orbitrap质量分析器，在该模式下，多个被独立分开的母离子可同时进行分析检测。

　　Thermo Scientific Pinpoint软件可以定量分析所有的同位素，或者一个又或者是一组同位素，每一个同位素都将得到多个提取离子流图（XICs），用来定义一个离子。Pinpoint软件还可提供给分析人员稀释线，每一次进样都会对样品组进行数据计算，通过给出的这些肽段能够确定定量下限和检测下限。通过Pinpoint软件可以很轻易的将肽对进行分组，从而获得H/L离子化比率并进行绝对定量。

　　HR/AM目标定量分析

HR/AM目标定量分析流程

　　HR/AM定量方法结合了Q Exactivex质谱的高精确质量和高分辨率，可以获得肽段的高灵敏度和精确质量的定量结果。HR/AM肽段定量分析流程给定性分析提供了一个简单的转换，例如针对早期定量分析鉴定和筛查。该分析流程为以前很难进行精确定量分析的蛋白质提供了可靠的分析方法。同时，HR/AM定量方法也是TSQ Vantage三重四极杆质谱SRM分析流程的一个强有力的补充。

　　最后，Andreas FR Huhmer博士总结到目前仍旧需要高性能蛋白质研究工具的出现，以推动发现生物学研究和药物发现领域中目前没被发现的人类基因组。一个可被广泛应用的高分辨率的蛋白质检测方法的出现，用以满足目前蛋白质检测的需求，用来进行复杂蛋白质组学的系统研究。基于高分辨率的Orbitrap质谱能够消除复杂基质分析中的干扰，增强信心，从而更快的推动周期生物学的研究发展。赛默飞世尔科技致力于技术的创新，不断推动质谱工具及相关技术的发展，并为用户提供完整的工作流程解决方案。

　　在大会前期举办的培训期间，来自赛默飞世尔科技蛋白质组学软件战略营销经理David Horn先生介绍了糖蛋白分析的相关软件方案，包括Proteome Discoverer软件、ProteinCenter软件、ProSightPC 软件的特点及具体应用。

赛默飞世尔科技蛋白质组学软件战略营销经理 David Horn先生

　　Proteome Discoverer软件

　　灵活的Orbitrap质谱系统能够产生大量的数据组，大多数的数据库搜索软件无法被有效的利用，该问题的解决方案为Proteome Discoverer工作流程能够集成复杂的MS/MS分析。

　　Proteome Discoverer是一款新的蛋白质组学分析软件平台，提供最全面的蛋白质组学定性定量数据查看。Proteome Discoverer使研究者可以在比以往更大的规模上，在一个程序里合并和比较从多个搜索引擎、公共数据库和裂解方法中获得的数据，并且易于使用、灵活。

　　Proteome Discoverer一个主要的优点是从多种裂解方法中分析信息的能力，从而去发现更多的翻译后修饰（PTMs），并提高多肽和蛋白鉴定的准确度。比如，在单次操作中，CID（碰撞诱导解离）和ETD（电子转移解离）数据能被同时分析，提供结果的序列、翻译后修饰和交叉确认信息。

　　使用Proteome Discoverer的工作流程引擎，Proteome Discoverer使研究者可合并搜索引擎结果和公共数据库信息，提供交叉确认的多种方法。例如，从Mascot™和SEQUEST等不同的搜索引擎中获得的数据，可被合并入单个的报告中。其它的软件特征包括：错误发现速率的自动化计算，可允许比较数据库搜索引擎的结果。

　　ProteinCenter软件

　　Unimod（www.unimod.org）上包含了673个目前已发现的肽段修饰，所有这些肽段修饰在一个单独的数据库里检索是不切实际的，尤其遇到一个肽段发生多个修饰的情况。那如何能够最大化的鉴定肽段修饰，并且保证搜索的可行性。针对上述问题赛默飞世尔科技推出了ProteinCenter软件，该软件是一个基于网络的工具，可对蛋白质组学数据执行更快更好的积分，解析和共享。

　　全新Thermo Scientific ProteinCenter软件是一个基于网络的工具，可对蛋白质组学数据执行更快更好的积分，解析和共享。它连接着来自Thermo Scientific Proteome Discoverer软件的以多肽为中心的信息，该软件还具有以蛋白质为中心内容的常用生物数据库，如UniProt和NCBI数据库。用户可利用这些数据库在数分钟内完成数据的比较和解析。 ProteinCenter™ 软件现在包括超过1300万个独特的蛋白质序列，并隔周访问，更新和整合面向公众的蛋白质信息。

　　ProSightPC软件

　　ProSightPC 2.0软件它最初是为“自上而下”（top-down）的蛋白质鉴定和表征而设计的，现在可以支持所有高质量精度、高分辨率的串联质谱蛋白质组学实验。ProSightPC 2.0可以对所有高质量精度的二级质谱（MS2）数据进行高通量处理，无论其来自“自上而下”(top-down)，“自中而下”(middle-down)，还是“自下而上”(bottom-up)的实验，而且ProSightPC 2.0软件能够鉴定任一类型的修饰，包括系列切断、翻译后修饰以及单核苷酸多态性。

　　ProSightPC软件通过重复的搜索从而得到最大化额度鉴定数据组，最大限速的提高分析结果的准确性。

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