一般来讲PCR升降温速度越快，实验需要的时间越少。需要的时间越少，意味着在中间温度可能产生的非特异扩增越少。并且，通常升降温速度，也从侧面体现了仪器控温能力的好快。
PCR仪就价格来看，每秒变温越多（现在主流的是每秒4到7摄氏度），价格就越高，仪器越好。主要因为加热模块材质的差别。
设置步骤：
1. 在主菜单上点击 New Protocol。
2. New Protocol 界面显示图形视图模式的程序（图3）。点击相应的按键设定对应的参数：
*温度
*时间
*循环数
*GOTO 循环开始步骤
*样品体积
*热盖温度
3. 如果想选择一个步骤，点击温度键以外空白区域，该步骤会高亮显示。此时可在该步骤后增加新步骤、删除所选步骤或重新输入该步骤的参数。
4. 点击 Insert 按键增加实验步骤。菜单会显示所需增加的步骤类型。温度固定的步骤选择Temperature，温度梯度步骤选择 Gradient，典型循环步骤（变性，退火和延伸）选择 GOTO。
5. 点击 Delete，删除实验步骤
6. 如果实验步骤需要设置高级参数，如温度，增减温度，时间，延伸时间，梯度和升降温速率，请点击 Options。
7. 点击 Save 保存程序
8. 点击 Run 运行程序。如果无需保存，可在设置过Run程中随时点击 开始运行。
设定温度：
设定温度(范围4.0-99.0度,最小单位为0.1度),时间(范围0:00:01-9:59:59,最小单位为秒)。
温度单位是摄氏度,时间顺序为小时、分钟、秒,可选指令TEMPRETURE INCREMEN每个循环温度修整量。
“+”表示升温,“-”表示降温,设置范围0.0-10.0度,最小输入单位0.1度。TIME INCREMENT每个循环时间修整量。
“+”表示时间增加,“-”表示时间减设置范围0.00:01-0:01:00,最小单位为1秒RAMR加热/冷却的最大梯度。
设置范围0.3-3.0度/秒,最小单位0.1度/秒RAMP NCREMEN于每个循环的梯度修整量。设置范围0.0-1.0度/秒最小单位0.1度/秒。
