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circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(一)

2021.2.23

环状RNA (circRNA)作为新型非编码RNA,具有比线性RNA更加稳定的环状结构,可通过多种机制调控靶基因。近年来,circRNA被发现在多种肿瘤组织和细胞中异常表达,作为肿瘤的诊断生物标志物或治疗靶点,具有巨大的价值,受到广泛的关注。癌症新的证据表明,circRNAs在癌症的发生发展中起着重要的调控作用。云序用户山东大学刘志方课题组近期在Molecular Cancer杂志上发表的文章,通过全转录组测序、分子实验和细胞动物表型实验探讨了hsa_circ_0004872在胃癌(GC)中的作用及其调控机制。

1.题目.png

 

 



发表杂志:Molecular Cancer
影响因子:15.302
发表时间:2020.11.10
技术方法:全转录组测序RIP-qPCRpull down双荧光素酶实验ChIP
文章链接:Circular RNA hsa_circ_0004872 inhibits gastric cancer progression via the miR-224/Smad4/ADAR1 successive regulatory circuit

1. 高通量测序筛选发现hsa_circ_0004872在GC中下调
作者通过对全转录组测序进行circRNA分析,筛选出4个在GC中差异表达的circRNA,通过在42对组织样品中进行qPCR验证筛选出差异最显著的hsa_circ_0004872,并通过sanger测序验证了反式剪切位点处序列。作者还进一步扩大样品量,在34对组织样品中qPCR验证了hsa_circ_0004872的差异表达,并通过酶耐受实验验证了该环状的稳定性。

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2. 细胞实验验证过表达hsa_circ_0004872抑制GC细胞增殖、侵袭和迁移
在GC细胞中通过构建的质粒过表达hsa_circ_0004872发现抑制了细胞的增殖、侵袭和迁移。而通过siRNA敲降hsa_circ_0004872则增加了细胞增侵袭和迁移。

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