中科院海洋研究所：看迟钝爱德华氏菌如何抑制细胞凋亡
细胞凋亡是多细胞生物中一种细胞程序性死亡，研究表明细菌性病原体可以抑制细胞凋亡。迟钝爱德华氏菌（Edwardsiella tarda）是一种革兰氏阴性病原菌，在淡、海水鱼类中感染极其广泛，其显著特征是可以在不同的宿主细胞中生存和繁殖。据报道，E. tarda能够躲避细胞内吞作用，在细胞质中复制，并在几次复制后通过溶解细胞膜进行扩散。然而目前E. tarda调控宿主信号通路的机制尚未知。
在这项研究中，中国科学院海洋研究所孙黎课题组，运用转录组测序技术，首次研究E. tarda侵染斑马鱼ZF4细胞全基因表达谱，并通过实时定量RT-PCR技术，探究E. tarda抑制细胞凋亡的相关机制。转录组分析显示，E. tarda在斑马鱼ZF4细胞中大量繁殖，其侵染细胞未检测到细胞凋亡信号。全基因组表达谱分析和实时定量RT-PCR显示，E. tarda侵染组织中促凋亡基因(Brms1a和Ivns1a)显著下调，抗凋亡基因(Fech和Prx3)上调表达。研究表明，过表达Fech和Prx3基因显著提升E. tarda在斑马鱼组织中的扩散和繁殖，而Brms1a和Ivns1a过表达则显著减弱E. tarda的扩散和繁殖。斑马鱼中敲除Fech和Prx3基因，E. tarda侵染被显著抑制，而敲除Brms1a和Ivns1a基因其侵染效果显著增强。
图 过表达和敲除Fech,Prx3,Brms1a和Ivns1a基因在细胞凋亡蛋白酶活性中的作用
本研究首次表明，E. tarda可以作为一种硬骨鱼类阻止细胞凋亡的细胞内生存途径，硬骨鱼类中一些公认的凋亡基因在细胞凋亡途径中的作用，某种程度上可能与哺乳动物类似。
本研究中的转录组测序由联川生物协助完成。
用户文章
Zhou ZJ,et al.(2016)Edwardsiella tarda-Induced Inhibition of Apoptosis: A Strategy for Intracellular Survival.Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. doi:10.3389/fcimb.2016.00076.
关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。
