【求助】如何计算蛋白分子量

最新回复

• xiaoxiaoniao (2013-7-31 10:35:09)

  什么软件啊，直接算不行吗？130bp/3*120=5200

• yes4 (2013-7-31 10:36:04)

  
  太多 计算的软件了，不过网站也可以的，如EXPASY。
  我记得平均氨基酸的的分子量为110Da

• abc816 (2013-7-31 10:36:27)

  
  你翻译出来氨基酸序列
  可以在网页中计算比如说
  cuturl('http://www.proteomics.com.cn/tools/mwcal/')
  也可以下载软件计算比如说
  cuturl('http://www.newasp.net/soft/softdown.asp?softid=13837')

• 大海啊故乡 (2013-7-31 10:36:52)

  先谢过楼上诸位：
  软件算的是挺方便，不过结果可靠吗？大家都是这样算的吗--先翻译成氨基酸序列，然后提交给计算机直接读数？
  我听说还得加上我的标签大小，但我的载体上才有标签，目的基因上没加，怎么办？大家有人听过这种算法吗？

• nut6694 (2013-7-31 10:37:16)

  
  你的标签是什么啊，把它的分子量加上不就行了吗

• junhun (2013-7-31 10:37:37)

  
  按10AA约为1KD来粗算

• 分子式 (2013-7-31 10:38:13)

  
  130*3/110就是你要的蛋白分子量吧！

• tianmei001 (2013-7-31 10:38:39)

  先谢过楼上诸位：
  软件算的是挺方便，不过结果可靠吗？大家都是这样算的吗--先翻译成氨基酸序列，然后提交给计算机直接读数？
  我听说还得加上我的标签大小，但我的载体上才有标签，目的基因上没加，怎么办？大家有人听过这种算法吗？
  
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  如果是原核表达，应该是比较可靠的，因为没有羰基化等对分子量影响较大的翻译后修饰。酵母、细胞等表达系统则另当别论。
  这里有个概念问题。你要计算的蛋白是什么？标签是在融合蛋白上的一个特定aa序列，如果你的蛋白以融合形式表达，当然要将标签计算在内。最简单的方法是将重组载体中含有目的基因的那个ORF考出来，用软件翻译成aa，再计算该aa的分子量。
  “但我的载体上才有标签，目的基因上没加，怎么办？”再学习一下“标签”的概念。