囊包可分为下列各种类型。

（1）保护囊包（resistance cyst德文 Schutzz－yste）：多为淡水产及寄生性的，由于囊膜的物理性和化学性稳定坚固，所以能耐受外界的干燥、高温和寒冷。

（2）休眠囊包或休眠孢子（resting cyst，res-ting spore德文Ruhezyste）：是囊膜内的个体处于生理性休眠状态的囊包。

（3）接合囊包（gamocyst德文Gamozyste）：是两个配子接触后，为同一囊膜包裹，然后相互接合形成接合子。

（4）接合子囊包或接合子孢子（oocyst德文Oozyste）：是两配子接合后形成接合子，再分泌分泌物而形成的囊包。

（5）孢子囊包（sporocyst德文Sporozyste）：是接合子在囊膜内经多次分裂而形成的囊包。因而也可称为增殖囊包（multiplication cyst德文Vermehrungsz-yste）。

（6）传播囊包或传播孢子（propagationcyst）：是寄生原虫（例如大肠阿米巴）以囊包状态进入新的寄主体内，然后在寄主体内脱去囊膜而裸露出来，再次进入活动状态。