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生物物种鉴定、发育阶段鉴定并定量?

2018.6.29

      如果说人类对地球的了解还只是皮毛阶段,相信很多人都不服气,但是,人类至今连哺乳动物这一类最容易统计的生物都没有完全搞清楚种数,可想而知对其他生物的了解程度能有多深了。形态学鉴定物种在微小生物、未知生物方面越来越吃力,分子生物学方法正在不断改善和弥补形态学的缺陷。

      一篇通讯作者为德国不莱梅大学海洋动物学系的论文(论文摘要地址:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0967063718300281)把MALDI-TOF MS用于浮游生物物种的种群和发育阶段鉴定并定量,产生了意想不到的结果。

       本论文作者认为,了解浮游动物群落结构对了解生态系统功能至关重要。因此,准确的物种鉴定是浮游生物研究的关键步骤。然而,从当前一系列方法论来看,物种丰富度仍然在很大程度上被低估和高分辨率分布模式仍然未知。作者采用了基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)来进行蛋白质组指纹识别鉴定和定量浮游桡足类生物。通过比较来自所有发育阶段的1178个标本的MALDI-TOF质谱峰值数据与之前的参考遗传库、形态学鉴定以及物种的蛋白质组指纹图谱,产生了25个有效的物种群,形成了“高分辨率”的物种分布图,该图谱甚至可辨出桡足动物群落的不同发育阶段,并对此“定量”。

      作者认为,MALDI-TOF MS蛋白质组学指纹识别在加速和改善群体分析方面具有巨大的潜力,能帮助获取有关生物多样性进程的新见解,以及系统地理学模式。这样的研究将有助于有效地检测和将生态系统变化联系起来,为生态研究的新能力打开大门。

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