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核糖核酸(RNA)测序

2021.6.10

  RNA在细胞中的稳定性较差,在实验中也更容易受到核酸酶的攻击。因为RNA是由DNA转录产生的,所以信息已经存在于细胞的DNA中。然而,有时也需要对RNA分子进行测序。虽然DNA测序给出了生物体的遗传图谱,但RNA测序却反映了细胞中活跃表达的序列。为了给RNA测序,通常的方法是首先对从样品中提取的RNA进行逆转录进而产生cDNA片段。然后可以如上所述方法进行排序。细胞中表达的大部分RNA是核糖体RNA或小RNA,不利于细胞翻译,但通常不是研究的焦点。然而,包括通常是研究的热点的丰富的信使RNA在内,这些都可以在体外除去。源自外显子的这些信使RNA将被翻译成支持特定细胞功能的蛋白质。因此,表达谱反应了细胞活性,特别是在疾病、细胞行为、对试剂或刺激的反应研究中。真核生物的RNA分子不一定与它们的DNA模板共线,因为内含子被切除了。这使得将读取的序列映射回基因组并由此识别它们的来源具有一定的复杂性。

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