dek35编码PPR蛋白影响玉米籽粒的线粒体nad4基因内...（一）

dek35编码PPR蛋白影响玉米籽粒的线粒体nad4基因内含子1的顺式剪接和发育

农林RNA测序助力玉米籽粒dek35突变体研究

该研究与前几天RNA测序在玉米籽粒dek2突变体中分子机制的研究应用相似，研究的主角依然是上海大学生命科学学院，该工作主要由陈鑫泽博士完成。研究对象由dek2突变体变为了dek35突变体。

研究思路

研究结果

dek35突变表现出发育迟缓的表型

本研究中dek35突变来源于美国玉米种质中心，编号为5605F。其表现出小籽粒，并且顶部种皮中空（图1）。突变体百粒重只有野生型20%（dek2是35%）（图1）。总淀粉、直链淀粉和总储藏蛋白含量没有显著变化，醇溶蛋白在突变体中显著下降。亚细胞层面观察发现，胚乳转移层细胞（BETL）在突变体中发育迟缓，表明籽粒发育受到抑制（图1）。

dek35基因克隆

研究人员对dek35突变体进行图位克隆，将其定位于玉米1号染色体254,244,136 bp to 289,337,516 bp大约35M区段内。由于该突变来源于Mutator突变系，研究人员怀疑其可能含有Mu的插入（图2）。对其进行Mu标签分离表明，一个Mu标签存在于35M的区段内，插入在了GRMZM2G066749起始密码子下游30bp处。该结果同样通过等位测试验证（图2）。

dek35编码了一个P-type PPR蛋白

研究人员通过将GRMZM2G066749蛋白编码序列在数据库中比对后发现，该基因编码了一个P-type PPR蛋白（图2）。

dek35在籽粒发育过程中持续性表达

研究人员通过定量PCR以及Western Blot杂交发现，dek35是一个全组织表达的基因（图3）。

dek35定位于线粒体中

将dek35连接入荧光表达载体，使其与黄色荧光蛋白YFP融合，并对其共聚焦显微镜亚细胞定位研究。结果发现，dek35定位于线粒体内嵴（图4）。