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生物医学文献知识发现研究获进展

2018.8.22

  近日,由中国科学院成都文献情报中心副研究员胡正银、研究员张志强与西南交通大学博士曾荣强、中科院广州生物医药与健康研究院覃筱楚、山西财经大学博士隗玲合作撰写的论文A Method of Biomedical Knowledge Discovery by Literature Mining Based on SPO predications: A Case Study of induced Pluripotent Stem Cells 被施普林格出版社出版的论文集Lecture Notes in Artificial Intelligence(LNAI)Series:Machine Learning and Data Mining in Pattern Recognition 收录正式发表,并被《工程索引》(The Engineering Index)收录。

  随着生物医学科技信息数量的快速增长和生命科学研究的交叉发展,生物医学文献知识发现(Knowledge Discovery in Biomedical Literature,KDiBL)已成为生物医学信息学的一个重要研究领域。论文围绕“诱导多能干细胞”(induced Pluripotent Stem Cells,iPSC)这一干细胞研究前沿知识发现的具体需求,基于干细胞领域知识图谱数据,从细粒度、富语义的生物医药信息知识表示、面向主题的知识挖掘及全景式知识可视化展示三个方面出发,以“主-谓-宾”(Subject-Predication-Object,SPO)三元组形式对iPSC领域科技文献中蕴含的知识元进行了深度揭示与组织,挖掘出iPSC影响要素、疾病类型、人体病灶组织和实验对象等多种类型的知识主题,并以语义网络的形式全景式地展示了iPSC领域的知识脉络,包括涉及的重要研究方法、实验技术、细胞器官、基因及治疗疾病等。

  相关研究工作得到国家社科基金重点项目“面向领域知识发现的学科信息学理论与应用研究”、中科院“十三五”信息化专项“面向干细胞领域知识发现的科研信息化应用”的支持,研究成果在“the 14th International Conference on Machine Learning and Data Mining”(MLDM 2018)作了大会报告。

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