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我国率先构建野生大豆泛基因组

2014.9.16

  中国农业科学院作物科学研究所与诺禾致源等合作,在国际上率先构建和分析了一年生野生大豆的泛基因组,为作物种质资源研究和利用提供了新的方法和启示。该研究成果9月14日在线发表于国际著名学术期刊《自然—生物技术》。

  项目牵头人、中国农科院作科所研究员邱丽娟介绍,大豆是重要的油料和高蛋白粮饲兼用作物。栽培大豆由其祖先种一年生野生大豆经过人工选择进化而来,其中所蕴藏的优异基因的开发和利用对拓宽现代大豆品种的遗传基础,改良品质,提高对病虫害的抗性及对不良环境与气候变化的适应性具有重要意义。我国大豆资源总数居世界首位,其中一年生野生大豆占全世界野生大豆的90%。她表示,近年来,我国乃至世界大豆育种难以取得突破性进展、单产停滞不前,主要原因是目前大豆品种的遗传基础狭窄,匮乏的基因源成为制约栽培大豆育种研究的关键。

  项目组通过十余年大豆核心种质构建及遗传多样性研究发现,大豆是高度自交作物,一个基因组无法准确代表其物种基因的整体情况。为此,在系统研究基础上,选择7份有代表性的野生大豆进行从头测序和独立组装,构建了野生大豆泛基因组。利用一套基于全基因组序列比对的结构变异鉴定方法,项目组率先在全基因组水平上全面解析了野生和栽培大豆种间遗传变异,特别是在阐明大豆种内/种间结构变异方面取得了突破,发现野生大豆特有、栽培大豆特有及驯化性状建成相关的基因/遗传变异千余个,其中野生大豆特有基因为首次报道。此外,发现野生大豆中与生物逆境抗性相关的R(抗病)基因类型,可能是其抵御恶劣生存环境的内在原因之一。

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