活动性HSV感染（包括上皮性角膜炎、巩膜炎或巩膜外层炎）可用抗单纯疱疹病毒药物滴眼剂滴眼：碘苷（IDU）、阿糖腺苷（vidarabine，Ara-A）、三氟胸苷（trifluridine，F3TdR）和阿昔洛韦（ACV），每天不少于9次，共14～21天，在临床上是有效的。IDU、Ara-A有效且可用于既往药物不敏感或不能耐受的病例。长期口服ACV（200mg，5次/d） 可减少病毒的侵犯从而减少上皮性角膜炎、巩膜炎或巩膜外层炎的复发。长期口服ACV治疗疱疹性基质性角膜炎、葡萄膜炎效果不确定。已证实长期口服ACV并行穿透性角膜移植术可减少HSV性巩膜炎或角膜炎的复发。

　　对免疫性HSV巩膜炎的治疗与免疫性VZV巩膜炎相同。用含有微量的糖皮质激素、抗病毒药物ACV、CC等复方滴眼剂，有抗感染和抗炎症的双重疗效，无明显抑制修复和使病毒扩散的副作用。全身应用糖皮质激素，必须用相应预防的抗病毒药物如F3TdR滴剂，4次/d或口服ACV 200mg，5次/d。

　　病情凶险者，可用干扰素（interferon，IFN）或干扰素诱导剂聚肌胞（polycytosine,PIC）。酌情选用转移因子（transfer factor）及胸腺素（thymosin）等。

　　多次复发、经久不愈的病例，可大面积板层或全层角膜移植和（或）巩膜切除或移植。