Nature：测序人类皮肤微生物组 解析真菌多样性
历史上，人类很久以前就会利用真菌做面包和啤酒了，然而我们对居住在自己身体上的真菌却并十分不了解。
现在，美国国立卫生研究院(NIH)的研究人员，首次解析了人类皮肤上的真菌多样性。他们对健康人不同皮肤部位的真菌 DNA 进行了测序，明确了皮肤上正常真菌群落的构成，为研究真菌类皮肤病打下了基础。相关研究论文刊登在了近期出版的《自然》(Nature)杂志上。
人类皮肤表面的真菌、细菌和病毒组成了一个复杂的微生物生态系统，称为“皮肤微生物组”。真菌生长慢而且难于培养，这大大影响了相关皮肤病的诊断和治疗。 NIH 旗下的人类基因组研究所(NHGRI)和癌症研究所(NCI)，对 DNA 测序技术进行了优化，在 ABI 3730xl 和罗氏 454 测序平台上对皮肤真菌群落进行了分析。
研究人员发现，Malassezia 属的真菌在头部和躯干占据优势。而在带有多种细菌的手部，真菌种类却相对较少。与此相反的是，脚部(包括脚趾甲、脚跟和脚趾)的真菌多样性非常高。研究人员希望，通过解析人体上的真菌和细菌生态系统，更好的理解相关皮肤病。
研究人员在十位健康成年人身上收集了十四个部位的样本，并对样本中的真菌进行 DNA 测序。他们检测了被称为系统发育标记的 DNA 片段，以鉴别样品中真菌的种类。 DNA 测序技术最终生成了超过五百万个标记，代表了八十多种真菌。而传统的培养方法只能鉴定出18种真菌。研究人员指出，这是因为 DNA 测序可以检测到那些难于培养的真菌种类。
研究显示，脚跟部感染的不同个体，具有相同的脚跟真菌群体。而对于脚趾甲感染而言，不同个体的脚趾甲真菌群体差异很大。研究人员还发现， Ascomycetes 和 Basidiomycetes 真菌是 14 个部位上共有的正常真菌。所有健康志愿者的皮肤上都存在 Malassezia 真菌，这种最常见的真菌出现在 11 个部位上。
研究人员表示，以 DNA 测序为基础的鉴定方法，能够解析皮肤上真菌群落的构成。研究发现，真菌多样性依赖于皮肤所在的部位，与取样个体关系不大。这项研究主要针对容易发生真菌性皮肤病的部位。
研究显示，脚部的真菌组成最为复杂，约有80种真菌，其他部位则比较少。研究人员将同一人身上的真菌多样性与细菌进行比较，发现手臂细菌多样性高而真菌多样性低，而脚部则刚好相反。另外，在身体主要部位的皮肤上，细菌和真菌的多样性都不高。
研究人员还发现，同一人身体左右两侧的真菌群落结构非常相似。而且皮肤上的真菌群落相当稳定，在相隔三个月的两次检测中差异不大。
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