3月7日下午，评估专家组对重点实验室进行了现场考察，考察重点实验室的科研环境和仪器运行等情况，听取了科研人员在最新研究进展、运行管理等方面的介绍；同时还考察了共聚焦显微镜、全自动生化仪、500兆核磁等重要科研仪器的开放运行情况。
在随后进行的个别访谈中，专家组选取了实验室管理人员、中青年科研骨干等4位实验室固定成员和两名研究生分别进行个别访谈，针对实验室满意度、个人发展、经费管理、设备共享等方面进行了调查。同时，评估组工作人员对评估材料进行了全面核查，附件材料与申报材料完全一致，并且分类清晰，得到了管理专家的高度赞扬。
3月8日上午，专家组对评估情况进行了口头反馈，对重点实验室五年的工作给予了肯定，同时也提出了建设性的意见和建议，对实验室提出了更高的期望，希望科研人员们发挥更大的作用。
新药研究国家重点实验室自成立以来，在2001年和2006年两次评估中均获得优秀。重点实验室全体成员对2011年现场评估高度重视，各项评估准备工作有序展开。