菌落计数器使用方法(三)
(1)正确的计数区域(绿色区域在培养皿内轮廓内)
(2)错误的计数区域
选定计数区域后点击鼠标左键,“确定选择区域”。如需重新选择样品相片,则点击右键,系统将取消计数区域选择。选定计数区域后,系统将自动处理样品相片,并弹出一级控制台:
一级控制台
在此控制台中,用户可以通过八个图像处理通道和一个阈值调整滑动条进行调整和修正。步骤如下:
1、通过选择图像处理通道,按照不同的方案处理样品相片。从中选择最为符合样品相片形态的结果。(默认通道为“灰度”通道,适用于大多数菌落相片,但对于不同的菌落形态,可以选择不同的处理通道,已达到更好的效果)
2、在基本结果的基础上,可以通过调整阈值,对处理结果进行微调(大多数情况下,系统自适应的阈值即为最优阈值,不需要微调,直接确定即可)
阈值调整滑动条
确定图像处理结果后,点击“确定”按钮,调出二级控制台及菌落分布结果。橘黄色圈所圈定的区域,即为系统识别菌落。用户可以通过左边的控制台,对此判定进行修正,并最终确定菌落结果。
主要操作方法为:
“手动添加”按钮 :可以在结果图片上手动添加菌落识别框,通过鼠标滚轮可调节识别框大小。
“手动删除“按钮 :可以手动删除一些错认的菌落,通过鼠标滚轮调节删除区域大小,可以有选择的单独删除,也可以面积删除。只要删除框内包括菌落识别框圆心,即可删除。(注意:手动删除仅在“保存该类”按钮未按下之前有效,“保存该类”后,将不能手动删除)
“采样“按钮 :对于某些较为复杂的识别结果,可以通过“采样”手段来筛选所需菌落形态。
即:首先点击“采样”,圈选一个符合要求的菌落,(注意:圈选框应略小于所选菌落,否则会引起较大误差,圈选的菌落尽量选择较大较为典型的菌落)。再通过调节“半径”和“允许范围”来调节系统根据典型菌落所识别出的相似菌落数。 ,确定后点击“保存该类”按钮生成该类。如样品图片中含有超过一种类型的菌落,则反复操作“采样”---“调整”---“确定”步骤,直到完全圈选完所有种类,再点击“保存并退出“按钮,完成计数。
“默认参数”:当调整参数偏离较大时,点击“默认参数”按钮,使参数恢复到默认状态。
“恢复上一步”按钮:恢复上一步操作。
“清空”按钮:取消使用者在第二控制台对图片的所有操作,使样品图片恢复到初始状态,即第一控制台确定后的状态。
“统计结果”:显示当前已确认菌落的数值。
“保存并退出”:保存菌落计数结果并退出,并将数据计入报表。(正常计数结束后,按此按钮退出“
“退出”:放弃计数结果并退出,计数结果不理想,希望重新开始技术环节,按此按钮退出。
“采样直径”:采样点的直径选择,与鼠标滚轮操作效果相同。
“半径”与“容许范围”:通过调整该两种参数的数值调节采样点与菌落点的半径相似程度,筛选不同形态的菌落,以取得较为合适的菌落点类型。
典型情况操作范例:针对不同的样品菌落分布形态分为三种情况进行处理:
第一种:菌落较为典型,形态近似于圆形,与背景差异明显。
例如: 对于这种情况,仅需在二级控制台通过简单的手动添加删除菌落即可达到理想效果。
第二种:菌落较为细小,且形态不分明,近似于小点,与背景差异明显。
例如: 对于这种情况,需要在选定计数区域之前在“ ”按钮中,选择“高”精度来进行特别处理,辅之以手动添加删除,即可以进行有效的计数分析。
第三种:菌落形态不规则,背景有大量的水渍、暗纹等干扰信号,菌落大小不一差异较大。
例如: 对于这种情况,首先在一级控制台中对阈值进行微调,筛去不符合条件的一部分污渍
再在二级控制台中选择“采样”按钮,选择典型点进行采样,调整“半径”和“容许范围”筛选符合菌落形态条件的区域。
通过多次采样采集到符合条件的菌落类。
再通过手动添加删除筛选部分噪点
得到最终菌落识别图片。
点击“保存及退出“完成计数环节。