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Science深度对话，改写教科书上的遗传学规则
如果你打开任何一本生物学教材翻到蛋白质的部分，你将会学到蛋白质是由氨基酸序列组成，序列决定了氨基酸链如何折叠成一种紧密的结构，且这种折叠蛋白质的结构决定了它的功能。换句话说，序列编码结构，功能源自结构。
然而教科书有可能不得不改写。Rohit Pappu和他的两位同事在9月20日《科学》（Science）杂志上的一篇perspective文章中，揭示了一大类没有遵循结构-功能范例的蛋白质。这些所谓的内在无序蛋白质无论整体或部分均不能折叠，但它们是具有功能的。
近期我们坐下类与圣路易斯华盛顿大学生物系统工程学中心的主任、生物医学工程学教授Pappu博士一起追踪了这一最新的科学。
什么时候人们意识到一些蛋白违背了规则？
已经大约有20年。最早的线索是一些蛋白质片段没有显示在X射线晶体学或NMR研究中，这些是研究蛋白质结构的标准方法。
到上世纪90年代，从事蛋白质与DNA互作机制研究的人们已经注意到当蛋白质与DNA相互作用时它们常常会改变形状。在没有DNA的情况下，所有用于蛋白质结构的标准探针返回的报告显示蛋白质是松散的，而当蛋白质与DNA形成复合物时则具有明确定义的三维结构。
你最初是怎样听说它们的？
偶然。当我2001年正准备离开约翰霍普金斯大学转去华盛顿大学之时。我与印第安那大学医学院的Keith Dunker进行了一次会面，他是该领域的开创者之一。这纯属巧合。这次是会面以尴尬的方式开始因为Keith不知道我是谁，我也从未听说过他。我正在从事未折叠蛋白的聚合体物理学描述工作，岂料他刚刚写了一篇80页的关于内在无序蛋白的综述论文。
他说：“每次你与蛋白质科学后巷中的人们谈话，他们都会告诉你他们的蛋白质是非常灵活或高度动态的，这种动态对于功能极其重要。”
因此Keith做了两件事情。他综合了所有的信息，然后了解了这些灵活的高度无序的蛋白。与他的同事Vladimir Uversky一起，他提出了疑问是否有可能预测哪些序列是无法自主折叠的。在计算机科学家们的帮助下，教给他如何寻找高维空间中的模式，他知道了20种氨基酸中有11种倾向于是无序的。现在有大约20个无序预测因子。
因此当我听到这个故事，我想：“好的，这要么绝对是错乱的，要不是将要变形的。我打赌是变形的，因为我发现他所说的是令人信服的。”
因此在华盛顿大学的头两年我开始大量涉猎文献，我想我吓坏了这里的许多人，他们不知道他们已经聘请了此人，还以为他们正在招聘。
