成虫

成虫外部形态及内部结构相似，虫体乳白色，细如丝线，体表光滑。头端略膨大，呈椭圆形。雌虫尾部钝圆，生殖器官为双管型，阴门位于近虫体头端的腹面，卵巢位于虫体后部，子宫粗大，近卵巢段含大量卵细胞，成熟虫卵壳薄而透明，内含卷曲的幼虫，在向阴门移动过程中，卵壳伸展而形成鞘膜，包被于幼虫体表，此幼虫称微丝蚴(microfilaria)。雄虫尾端向腹面卷曲2～3圈，生殖器官为单管型。 雌虫直接产微丝蚴，故其生殖方式为卵胎生。马来丝虫雌虫大小为（43~55）mm ×（130~170）μm；雄虫约为（13~23）mm ×（70~80）μm。

微丝蚴

虫体细长，头端钝圆，尾端尖细，外被鞘膜，体态硬直，大弯上有小弯。角质层光滑具有纤维环纹。在新鲜血片中，光镜下可见虫体无色透明，做扭曲运动。经吉姆萨或瑞氏染色，体内可见很多圆形或椭圆形体核，头部无核部位为头间隙，长度约为宽度的2倍；虫体前部1/5处有神经环，其后为排泄孔，排泄孔后有一个排泄细胞；腹侧有肛孔，尾部有2个尾核，前后排列，尾核处较膨大。

感染期幼虫

又称丝状蚴，见于中间宿主蚊的胸肌或下唇部位。虫体细长，平均体长1.304μm，具有完整的消化道，尾端有3个乳突（背面1个，腹面2个）。丝状蚴的活动力强，当蚊虫叮咬人体时经皮肤侵入。