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LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平

2021.3.01

核酸修饰概要 :

DNA/RNA 修饰是表观遗传修饰的重要层面,指的是在 DNA、RNA 碱基 A\T\G\C\U 及核糖上的各种修饰。目前己发现的 DNA 修饰有十几种,而 RNA修饰有 100 多种,其中甲基化修饰占大部分,目前研究也较为普遍,并且可能具有重要生物调控作用。

部分核酸修饰示意图

实验原理:
云序生物建立了一种基于 LC-MS/MS 平台的核酸修饰分析方法,定量 4类 DNA 修饰(5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA)和 9 类 RNA 修饰(m5C、 m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C),为表观遗传研究提供理想的技术平台。 
液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物,并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS 法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法;而将 LCMS/MS 法与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的 DNA/RNA 修饰进行检测。核酸修饰分析流程如下图:

核酸修饰检测流程示意图

核酸修饰检测周期 :
核酸修饰检测周期为 30 工作日
样本要求:

样品要求



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