利用GWAS方法挖掘谷子资源中蕴含的抗谷瘟病基因
谷子是中国传统粮食作物，具有抗旱耐贫瘠、营养丰富平衡、粮草兼用、耐储存等特点，作为谷子三大病害之一的谷瘟病，严重影响谷子产量和商品品质，目前对谷瘟病的研究仅局限于抗病性鉴定和评价，有关抗谷瘟病基因的研究尚未见报道。
近期，中国农业科学院作物科学研究所刁现民研究组完成的题为“Identification of blast-resistance loci through genome-wide association analysis in foxtail millet (Setaria italica (L.) Beauv.)”的研究论文在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 2021年8期正式发表。
该研究对888份谷子核心种质资源进行谷瘟病菌接种鉴定，对谷子核心种质资源抗性分布进行了统计，并利用GWAS方法挖掘谷子资源中蕴含的抗谷瘟病基因，通过与水稻annotion数据库比较，筛选抗谷瘟病候选基因，为抗谷瘟病分子标记辅助育种聚合抗谷瘟病基因打下基础。
该研究利用HN-1谷瘟病菌对888份谷子核心种质资源进行接种鉴定，结果发现，仅有不超过1.6%的谷子资源是高抗材料；中抗和中感的比例分别为32.25%和57.09%；高感的谷子资源占到6.08%。通过GWAS全基因组关联分析、生物信息学分析、水稻数据库注释及转录组分析，筛选出Seita.2G097400、Seita.2G097500、Seita.2G096500、Seita.9G359000、Seita.9G359500、Seita.9G360700、Seita.9G361300和Seita.9G361900等8个抗谷瘟病候选基因，为谷子抗谷瘟病育种实践提供理论指导。
中国农业科学院作物科学研究所刁现民研究员为该文章的通讯作者，博士生李志江和贾冠清研究员为该论文共同第一作者。该研究得到了国家重点研发项目（2018YFD1000706和2018 YFD1000700）、国家自然科学基金（31871630和31771807）、国家谷子高粱产业技术体系（CARS-06-13.5）和黑龙江省农业科学院基金培育项目（2018JJPY005）的资助。
