新的方案用7个大肠杆菌菌落取代了保险丝，而每个菌落又被赋予了一个不同的荧光蛋白质基因。只有当这些基因被开启从而使细菌合成蛋白质时才会发出荧光。而其颜色——包括黄色、绿色和红色——变化则取决于哪种基因得到了表达。所有这些差别都能够被肉眼清楚地识别。凭借手中的多彩细菌菌落，研究人员随后利用一对颜色不同的细菌创建了一个代码。而7种颜色使得他们拥有了49种组合，从而能够用来编码26个不同的英文字母以及23个字母数字符号，例如“@”和“$”。他们用若干对有色细菌写了几排信息。为了“印刷”这些信息，研究人员将细菌转移到一个琼脂板上，后者是一种细菌的生长介质，之后又压上了一张硝化纤维“纸”，其目的是为了固定这些细菌。
此时此刻，硝化纤维纸中的细菌依然是看不见的。但是通过将硝化纤维纸压入包含有化学触发剂——能够激活荧光蛋白的表达——的琼脂板，信息的接收者便可以开启关键的基因，并点亮各种颜色。(被选择用来点亮的蛋白质通常不会被细菌所使用，所以除非被研究人员激活，它们通常保持静默。)只要接收者知道哪种颜色相当于哪个字符，信息便被知晓了。但是Walt和他的同事还增加了一个额外的保障。他们在一些细菌中插入了对抗特定抗生素的基因;其想法是只有耐抗生素的细菌携带的才是真正的信息。如果这些信息落入到错误的手中，一旦基因被激活，接收者将会看到一片混乱的颜色而无法阅读。但是如果接收者加入了正确的抗生素，不具抗性的细菌及其颜色便会消失，从而使真正的信息变得清晰起来。第一个例子便是在9月26日出版的美国《国家科学院院刊》中写着的“this
is a bioencoded message from the walt lab @ tufts university 2010”。