转双价棉对土壤细菌多样性的影响之DGGE-克隆测序分析
将条带a、b[图1.14(i)]和条带c[图1. 14(ii)]进行克隆测序后，将测序结果与GenBank数据库序列进行比对，每条带的近缘菌见表1.11。条带a属于a变形菌纲(Alphaproteobacteria)苍白杆菌属(Ochrobactrum)、条带b是未经培养的细菌、条带c属于a变形菌纲鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas），相似度分别为100%、97%和99%。这些菌属中Ochrobactrum属为化能异养菌，能利用各种氨基酸、有机酸和碳水化合物为碳源；Sphingomunas属的一个显著特征是降解多环或单环芳香族化合物，因此它的数量的变化可能与根分泌物中芳香族化合物的量有关。
表1. 11 DGGE条带的确认及根据测序结果推测的DGGE条带代表的细菌
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